More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1188 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1188  penicillin-binding protein transpeptidase  100 
 
 
767 aa  1525    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1280  peptidoglycan glycosyltransferase  56.63 
 
 
888 aa  706    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.547903  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1673  peptidoglycan glycosyltransferase  56.61 
 
 
899 aa  714    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000249988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4774  penicillin-binding protein transpeptidase  39.14 
 
 
750 aa  466  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.11 
 
 
671 aa  266  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  31.88 
 
 
639 aa  245  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1624  penicillin-binding protein 2  27.53 
 
 
738 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  29.03 
 
 
645 aa  240  5.999999999999999e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  31.45 
 
 
642 aa  239  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  27.92 
 
 
701 aa  237  5.0000000000000005e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  30.41 
 
 
640 aa  235  3e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  29.49 
 
 
630 aa  231  4e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  30.49 
 
 
643 aa  230  8e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  29.25 
 
 
637 aa  228  3e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  30.86 
 
 
626 aa  227  5.0000000000000005e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  31.41 
 
 
609 aa  226  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  29.32 
 
 
646 aa  226  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  30.73 
 
 
574 aa  226  2e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  32.14 
 
 
630 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  28.15 
 
 
629 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  28.14 
 
 
655 aa  221  3.9999999999999997e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  29.88 
 
 
631 aa  219  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  28.27 
 
 
645 aa  219  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  29.71 
 
 
643 aa  219  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  26.25 
 
 
618 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  26.25 
 
 
618 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  26.25 
 
 
618 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  26.25 
 
 
618 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  28.14 
 
 
647 aa  219  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  26.84 
 
 
636 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0580  peptidoglycan glycosyltransferase  30.97 
 
 
605 aa  217  5.9999999999999996e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0863238  normal  0.0511746 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  26.6 
 
 
618 aa  217  7e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  26.6 
 
 
618 aa  217  7e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  26.74 
 
 
618 aa  217  8e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  27.44 
 
 
661 aa  217  8e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  30.1 
 
 
629 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  28.78 
 
 
629 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  30.1 
 
 
629 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  30.07 
 
 
636 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  30.1 
 
 
629 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  26.31 
 
 
618 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  26.72 
 
 
610 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  30.24 
 
 
631 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0855  peptidoglycan glycosyltransferase  29.32 
 
 
618 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000272636  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  26.68 
 
 
618 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  29.64 
 
 
631 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  27.48 
 
 
634 aa  214  4.9999999999999996e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  32.92 
 
 
646 aa  214  7e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  27.9 
 
 
655 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  28.72 
 
 
629 aa  213  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  26.42 
 
 
617 aa  213  1e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1170  penicillin-binding protein 2  28.29 
 
 
633 aa  212  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.117814  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  28.64 
 
 
610 aa  212  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  25.99 
 
 
628 aa  212  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1138  peptidoglycan glycosyltransferase  32.7 
 
 
687 aa  211  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3741  penicillin-binding protein 2  28.1 
 
 
631 aa  211  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  28.62 
 
 
607 aa  211  4e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5929  penicillin-binding protein 2  31.62 
 
 
663 aa  210  7e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1329  penicillin-binding protein 2  26.28 
 
 
617 aa  210  8e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  29.26 
 
 
630 aa  209  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00604  transpeptidase involved in peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 2)  29.6 
 
 
633 aa  208  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0219544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  29.6 
 
 
633 aa  208  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298209  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0756  penicillin-binding protein 2  28.82 
 
 
633 aa  209  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151758  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1454  penicillin-binding protein 2  29.83 
 
 
684 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0742  penicillin-binding protein 2  28.82 
 
 
633 aa  209  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.302066  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  29.3 
 
 
602 aa  209  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  29.21 
 
 
681 aa  208  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0687  penicillin-binding protein 2  29.6 
 
 
633 aa  208  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000614363  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00593  hypothetical protein  29.6 
 
 
633 aa  208  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0186683  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  29.95 
 
 
646 aa  209  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0682  penicillin-binding protein 2  28.82 
 
 
633 aa  209  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000220235  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1357  penicillin-binding protein 2  29.83 
 
 
684 aa  209  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.723027  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  26.49 
 
 
627 aa  209  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0655  penicillin-binding protein 2  29.6 
 
 
633 aa  208  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000471681  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  29.6 
 
 
633 aa  208  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0800  penicillin-binding protein 2  28.82 
 
 
633 aa  209  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.590609  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  29.6 
 
 
633 aa  209  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  29.17 
 
 
633 aa  209  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749016  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  29.3 
 
 
602 aa  209  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0696  penicillin-binding protein 2  28.82 
 
 
633 aa  209  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982712  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  29.6 
 
 
633 aa  208  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1513  cell elongation specific D,D-transpeptidase  30.49 
 
 
615 aa  207  4e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0564593  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  30.59 
 
 
633 aa  207  5e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  26.37 
 
 
637 aa  207  5e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  30.51 
 
 
646 aa  207  8e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  26.91 
 
 
611 aa  206  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  26.19 
 
 
610 aa  206  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0664  penicillin-binding protein  30.15 
 
 
612 aa  206  1e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164685  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1008  peptidoglycan glycosyltransferase  31.71 
 
 
640 aa  206  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  28.78 
 
 
646 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  31 
 
 
615 aa  205  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0590  penicillin-binding protein 2  30.62 
 
 
687 aa  204  4e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253689  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0671  peptidoglycan glycosyltransferase  30.62 
 
 
687 aa  204  4e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.195303  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  28.11 
 
 
664 aa  204  6e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  26.76 
 
 
679 aa  204  7e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  27.36 
 
 
627 aa  203  8e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0518  penicillin-binding protein 2  31.25 
 
 
625 aa  203  8e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000002903 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  29.51 
 
 
667 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0236  penicillin-binding protein 2  30.14 
 
 
646 aa  203  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0864486  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  25.56 
 
 
678 aa  203  9.999999999999999e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>