128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2298 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2298  putative signal peptide protein  100 
 
 		 532 aa  1090    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.288509  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4701  multicopper oxidase type 3  75.42 
 
 		 531 aa  792    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0213399  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  24.53 
 
 		 554 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  24.53 
 
 		 554 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  27.36 
 
 		 457 aa  66.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  28.24 
 
 		 640 aa  66.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3161  multicopper oxidase type 3  23.48 
 
 		 346 aa  66.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1611  multicopper oxidase type 3  23.74 
 
 		 346 aa  65.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.232426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  24.1 
 
 		 565 aa  61.6  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1680  multicopper oxidase type 3  26.52 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  24.81 
 
 		 505 aa  60.1  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  35.4 
 
 		 527 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1111  multicopper oxidase type 3  23.94 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.471204  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4552  multicopper oxidase, type 3  28.93 
 
 		 477 aa  57  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4700  hypothetical protein  26.5 
 
 		 2698 aa  56.6  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.709916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2722  multicopper oxidase, type 3  28.93 
 
 		 470 aa  56.6  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.597321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0735  multicopper oxidase type 3  28.93 
 
 		 470 aa  56.6  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  24.07 
 
 		 549 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1208  multicopper oxidase type 3  27.89 
 
 		 462 aa  56.2  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0477162  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2600  multicopper oxidase, type 3  29.45 
 
 		 462 aa  55.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345005  normal  0.652084 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2669  multicopper oxidase, type 3  30.22 
 
 		 443 aa  55.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.653416  normal  0.265787 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2198  multicopper oxidase type 3  28.93 
 
 		 470 aa  55.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0072  multicopper oxidase domain-containing protein  25.65 
 
 		 630 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.14066 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2381  multicopper oxidase type 3  35.85 
 
 		 576 aa  55.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0890594  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1040  multicopper oxidase type 3  28.25 
 
 		 609 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  36.7 
 
 		 546 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  36.7 
 
 		 546 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3593  multicopper oxidase type 3  26.04 
 
 		 368 aa  55.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3485  twin-arginine translocation pathway signal  29.56 
 
 		 471 aa  55.5  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1261  multicopper oxidase, type 3  28.93 
 
 		 463 aa  55.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0495  multi-Cu oxidase  28.93 
 
 		 470 aa  55.1  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.826219  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  37.38 
 
 		 544 aa  55.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  35.51 
 
 		 551 aa  54.7  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1266  multicopper oxidase type 3  28.3 
 
 		 470 aa  54.7  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000624567 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0315  multicopper oxidase type 3  24.1 
 
 		 452 aa  54.7  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246403  normal  0.0800044 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  23.77 
 
 		 551 aa  54.3  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  23.77 
 
 		 551 aa  54.3  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2297  putative signal peptide protein  25.67 
 
 		 2742 aa  54.3  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.992598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2656  multicopper oxidase, type 3  27.96 
 
 		 470 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3981  multicopper oxidase type 3  31.16 
 
 		 467 aa  53.9  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5862  multicopper oxidase type 3  27.56 
 
 		 448 aa  53.5  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3725  multicopper oxidase type 3  25.1 
 
 		 381 aa  53.5  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5686  multicopper oxidase type 3  33.33 
 
 		 471 aa  53.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2764  multicopper oxidase, type 3  28.05 
 
 		 431 aa  53.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2116  copper-resistance protein CopA  31.08 
 
 		 666 aa  52.8  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5100  copper-resistance protein, CopA family  30.43 
 
 		 640 aa  53.5  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0626586 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4753  twin-arginine translocation pathway signal  28.66 
 
 		 431 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209254  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3414  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  28.66 
 
 		 431 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5029  multicopper oxidase type 3  26.75 
 
 		 449 aa  53.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4102  multicopper oxidase type 3  28.66 
 
 		 431 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356721 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1204  multicopper oxidase  30.88 
 
 		 468 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  30.82 
 
 		 592 aa  52.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1573  copper-resistance protein CopA  31.76 
 
 		 664 aa  52.8  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2294  multicopper oxidase  29.79 
 
 		 431 aa  52.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198018  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  36.19 
 
 		 521 aa  52.4  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1810  multicopper oxidase, type 3  35.19 
 
 		 488 aa  51.6  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179953  normal  0.645558 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3257  CopA family copper resistance protein  34.19 
 
 		 581 aa  51.6  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.202502  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  37.04 
 
 		 373 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1967  multicopper oxidase type 3  23.48 
 
 		 375 aa  51.6  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1136  multicopper oxidase type 3  27.88 
 
 		 535 aa  51.2  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0174058 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0272  copper-resistance protein, CopA family  31.58 
 
 		 656 aa  50.8  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  37.74 
 
 		 477 aa  50.8  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0936  twin-arginine translocation pathway signal  30.66 
 
 		 455 aa  50.4  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1080  twin-arginine translocation pathway signal  30.66 
 
 		 455 aa  50.4  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0117  twin-arginine translocation pathway signal; putative copper resistance protein (copA)  26.22 
 
 		 455 aa  50.1  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2506  multicopper oxidase, type 3  23.15 
 
 		 561 aa  49.7  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000431664  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2910  multicopper oxidase type 3  32.43 
 
 		 460 aa  50.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546075  normal  0.0186019 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2456  multicopper oxidase type 3  23.86 
 
 		 360 aa  50.1  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9850  multicopper oxidase  25.64 
 
 		 449 aa  50.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1959  multicopper oxidase  29.41 
 
 		 433 aa  49.3  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5190  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  27.44 
 
 		 431 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  37.04 
 
 		 478 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4825  multicopper oxidase type 3  30.23 
 
 		 467 aa  48.9  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.355944 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4602  multicopper oxidase type 3  30.47 
 
 		 467 aa  48.9  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437612  normal  0.307335 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3353  multicopper oxidase type 3  27.44 
 
 		 431 aa  49.3  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2040  multicopper oxidase type 3  31.34 
 
 		 431 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  35.24 
 
 		 521 aa  48.5  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4634  twin-arginine translocation pathway signal  28.28 
 
 		 462 aa  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294072  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2455  multicopper oxidase type 3  37.27 
 
 		 359 aa  48.5  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0496  multicopper oxidase, type 3  29.91 
 
 		 467 aa  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6070  multicopper oxidase type 3  29.41 
 
 		 431 aa  48.5  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947276  normal  0.0665889 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2009  multicopper oxidase  29.1 
 
 		 397 aa  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4385  twin-arginine translocation pathway signal  28.91 
 
 		 459 aa  47.8  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2224  multicopper oxidase type 3  29.91 
 
 		 474 aa  48.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4026  multicopper oxidase type 3  29.46 
 
 		 432 aa  48.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3912  multicopper oxidase type 3  29.46 
 
 		 432 aa  48.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1840  copper-resistance protein, CopA family  29.35 
 
 		 604 aa  48.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71414  hitchhiker  0.0000125697 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2579  multicopper oxidase type 3  28.21 
 
 		 452 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.844134  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1031  multicopper oxidase type 3  28.21 
 
 		 473 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  24.51 
 
 		 358 aa  47.8  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  33.33 
 
 		 511 aa  47.8  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0714  multicopper oxidase family protein  29.1 
 
 		 433 aa  47.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403072  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0622  multicopper oxidase family protein  29.1 
 
 		 433 aa  47.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7874  multicopper oxidase type 3  26.9 
 
 		 464 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.994377  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  33.64 
 
 		 476 aa  47.8  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1634  putative exported copper oxidase  28.3 
 
 		 484 aa  47.4  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496536 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6291  multicopper oxidase type 3  27.44 
 
 		 431 aa  47.4  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.126651 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  27.78 
 
 		 561 aa  47  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4903  multicopper oxidase type 3  26.49 
 
 		 465 aa  47  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6519  putative multicopper oxidase  26.42 
 
 		 446 aa  47  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615925  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>