171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4701 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2298  putative signal peptide protein  76.92 
 
 		 532 aa  767    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.288509  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4701  multicopper oxidase type 3  100 
 
 		 531 aa  1091    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0213399  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  26.74 
 
 		 554 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  26.74 
 
 		 554 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  26.89 
 
 		 640 aa  76.6  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3161  multicopper oxidase type 3  26.14 
 
 		 346 aa  73.6  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  25.94 
 
 		 544 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  25.54 
 
 		 551 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  26.97 
 
 		 546 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  25.56 
 
 		 549 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  25.19 
 
 		 551 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  25.19 
 
 		 551 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  25.87 
 
 		 457 aa  69.7  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  23.88 
 
 		 505 aa  68.6  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0072  multicopper oxidase domain-containing protein  26.54 
 
 		 630 aa  67.4  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.14066 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  29.38 
 
 		 527 aa  67  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  38.89 
 
 		 546 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1040  multicopper oxidase type 3  26.21 
 
 		 609 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172495  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1611  multicopper oxidase type 3  24.85 
 
 		 346 aa  66.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.232426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3593  multicopper oxidase type 3  24.33 
 
 		 368 aa  65.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3725  multicopper oxidase type 3  26.44 
 
 		 381 aa  62.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  32.88 
 
 		 592 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1573  copper-resistance protein CopA  35.43 
 
 		 664 aa  62  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2116  copper-resistance protein CopA  34.65 
 
 		 666 aa  62  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  37.96 
 
 		 565 aa  61.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3257  CopA family copper resistance protein  36.43 
 
 		 581 aa  60.8  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.202502  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2455  multicopper oxidase type 3  35.88 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1680  multicopper oxidase type 3  25.82 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  30.73 
 
 		 478 aa  60.1  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  28.76 
 
 		 373 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1967  multicopper oxidase type 3  25.75 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2656  multicopper oxidase, type 3  26.54 
 
 		 470 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1947  putative copper resistance transmembrane protein  33.33 
 
 		 627 aa  57.8  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.809096 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2506  multicopper oxidase, type 3  24.06 
 
 		 561 aa  57.4  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000431664  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1111  multicopper oxidase type 3  24.35 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.471204  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4279  multicopper oxidase type 3  30 
 
 		 545 aa  57  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2381  multicopper oxidase type 3  35.85 
 
 		 576 aa  57  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0890594  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2722  multicopper oxidase, type 3  37.27 
 
 		 470 aa  57  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.597321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3231  copper resistance protein A precursor  36.8 
 
 		 607 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5380  copper resistance protein A  36 
 
 		 669 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.537951 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0315  multicopper oxidase type 3  24.81 
 
 		 452 aa  55.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246403  normal  0.0800044 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2456  multicopper oxidase type 3  29.63 
 
 		 360 aa  55.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  34.31 
 
 		 511 aa  55.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0735  multicopper oxidase type 3  36.36 
 
 		 470 aa  55.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4552  multicopper oxidase, type 3  36.36 
 
 		 477 aa  55.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0495  multi-Cu oxidase  37.27 
 
 		 470 aa  55.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.826219  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2198  multicopper oxidase type 3  36.36 
 
 		 470 aa  55.5  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3485  twin-arginine translocation pathway signal  38.18 
 
 		 471 aa  55.5  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4419  multicopper oxidase  32.04 
 
 		 376 aa  55.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1136  multicopper oxidase type 3  31.71 
 
 		 535 aa  55.5  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0174058 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37790  copper resistance protein A precursor  36 
 
 		 606 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00238596  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  36.36 
 
 		 561 aa  53.9  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1261  multicopper oxidase, type 3  31.17 
 
 		 463 aa  53.9  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1828  CopA family copper resistance protein  34.65 
 
 		 566 aa  53.5  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0272  copper-resistance protein, CopA family  35.48 
 
 		 656 aa  53.5  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2205  CopA family copper resistance protein  34.11 
 
 		 574 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5686  multicopper oxidase type 3  35.45 
 
 		 471 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1713  CopA family copper resistance protein  35.2 
 
 		 580 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0936  twin-arginine translocation pathway signal  35.45 
 
 		 455 aa  52.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1080  twin-arginine translocation pathway signal  35.45 
 
 		 455 aa  52.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1266  multicopper oxidase type 3  35.45 
 
 		 470 aa  53.5  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000624567 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00250  Copper-resistance protein A precursor CopA family  33.33 
 
 		 621 aa  53.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0267708  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  36.22 
 
 		 630 aa  53.5  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2669  multicopper oxidase, type 3  33.93 
 
 		 443 aa  53.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.653416  normal  0.265787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  36.22 
 
 		 633 aa  53.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2338  CopA family copper resistance protein  36.29 
 
 		 626 aa  53.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0017  CopA family copper resistance protein  34.4 
 
 		 652 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  25.32 
 
 		 358 aa  52.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0015  CopA family copper resistance protein  34.4 
 
 		 652 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5100  copper-resistance protein, CopA family  29.65 
 
 		 640 aa  52.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0626586 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5180  CopA family copper resistance protein  35.2 
 
 		 605 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1810  multicopper oxidase, type 3  35.19 
 
 		 488 aa  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179953  normal  0.645558 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1793  multicopper oxidase, type 3  35.94 
 
 		 307 aa  52.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0015  CopA family copper resistance protein  34.4 
 
 		 671 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.156592  normal  0.0651456 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1904  multicopper oxidase type 3  23.19 
 
 		 398 aa  52  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1208  multicopper oxidase type 3  34.55 
 
 		 462 aa  51.6  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0477162  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  33.64 
 
 		 476 aa  51.6  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2600  multicopper oxidase, type 3  34.55 
 
 		 462 aa  51.2  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345005  normal  0.652084 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0574  CopA family copper resistance protein  34.4 
 
 		 619 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  36.79 
 
 		 477 aa  51.6  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1840  copper-resistance protein, CopA family  33.87 
 
 		 604 aa  51.6  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71414  hitchhiker  0.0000125697 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0656  copper resistance transmembrane protein  34.62 
 
 		 605 aa  51.2  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1571  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  33.33 
 
 		 592 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.402228  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0496  multicopper oxidase, type 3  29.03 
 
 		 467 aa  51.2  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1266  copper-resistance protein, CopA family  37.27 
 
 		 594 aa  50.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0392055  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2224  multicopper oxidase type 3  29.03 
 
 		 474 aa  50.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3810  copper-resistance protein CopA  30.52 
 
 		 572 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1204  multicopper oxidase  34.55 
 
 		 468 aa  50.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3981  multicopper oxidase type 3  34.55 
 
 		 467 aa  50.8  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0108  copper resistance protein A precursor  35.51 
 
 		 606 aa  50.4  0.00008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0092  CopA family copper resistance protein  35.51 
 
 		 606 aa  50.4  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  32.73 
 
 		 464 aa  50.4  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  32.73 
 
 		 464 aa  50.4  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2579  multicopper oxidase type 3  33.33 
 
 		 452 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.844134  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  33.85 
 
 		 579 aa  49.7  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1031  multicopper oxidase type 3  33.33 
 
 		 473 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2219  CopA family copper resistance protein  33.6 
 
 		 604 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0710  CopA family copper resistance protein  32.17 
 
 		 568 aa  49.7  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2910  multicopper oxidase type 3  29.86 
 
 		 460 aa  49.7  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546075  normal  0.0186019 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5336  copper-resistance protein, CopA family  34.15 
 
 		 631 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>