69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0647 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0647  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  805    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2009  major facilitator transporter  22.96 
 
 		 418 aa  98.6  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0610699  normal  0.51216 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 399 aa  92.8  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2876  macrolide-efflux protein  27.34 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2460  macrolide-efflux protein  27.34 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5620  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 420 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  22.52 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0961  major facilitator superfamily MFS_1  22.13 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  21.72 
 
 		 420 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  21.45 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  23.89 
 
 		 420 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  24.49 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  23.61 
 
 		 420 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  21.18 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  21.18 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4122  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 423 aa  56.2  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  24.92 
 
 		 408 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  22.51 
 
 		 450 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3741  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 426 aa  51.2  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159847  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0240  transporter, putative  23.08 
 
 		 393 aa  50.8  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  27.42 
 
 		 424 aa  50.8  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  25.2 
 
 		 424 aa  50.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  21.45 
 
 		 420 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  24.79 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1663  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  28.77 
 
 		 209 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2250  major facilitator transporter  23.2 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2211  major facilitator transporter  23.2 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  20.41 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 		 399 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  22.93 
 
 		 453 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0479  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 427 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.742618 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1930  multidrug efflux transport protein EefD  24.4 
 
 		 387 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624404 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2232  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 432 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0534  hypothetical protein  24.18 
 
 		 412 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1833  multidrug efflux transport protein EefD  23.95 
 
 		 387 aa  47  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.531383  hitchhiker  0.0000436585 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2467  major facilitator family transporter  27.66 
 
 		 417 aa  47  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0074  major facilitator superfamily MFS_1  22.68 
 
 		 410 aa  46.6  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1780  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 448 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  26.71 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  26.1 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  22.62 
 
 		 407 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1780  transporter, putative  22.76 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2384  major facilitator superfamily MFS_1  22.26 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000361861  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  34.23 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  23.33 
 
 		 432 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27300  Na+/melibiose symporter-like transporter  30.09 
 
 		 435 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.566046  normal  0.31967 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1213  major facilitator superfamily MFS_1  32.41 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.979166 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  26.71 
 
 		 414 aa  44.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 454 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21441  putative multidrug efflux transporter, MFS family protein  24.91 
 
 		 471 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  29.57 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  29.57 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  29.57 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  29.57 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2289  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 432 aa  44.3  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.995339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1089  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 450 aa  43.9  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.10347  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  29.57 
 
 		 404 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 426 aa  43.5  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  24.76 
 
 		 461 aa  43.5  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.81 
 
 		 413 aa  43.5  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236916  hitchhiker  0.00655505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1702  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 		 438 aa  43.5  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101015  normal  0.0466104 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0494  molybdopterin biosynthesis protein  22.03 
 
 		 386 aa  43.1  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0903  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 413 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  21.32 
 
 		 402 aa  43.1  0.009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0909  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 413 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.485537  normal  0.0144612 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0920  major facilitator superfamily transporter  25.07 
 
 		 413 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5797  hypothetical protein  27.78 
 
 		 419 aa  43.1  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>