49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2680 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2680  membrane-bound metal-dependent hydrolase  100 
 
 		 355 aa  716    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0173837  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3169  membrane-bound metal-dependent hydrolase  86.25 
 
 		 359 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2546  membrane-bound metal-dependent hydrolase  86.25 
 
 		 359 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.355245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2700  membrane-bound metal-dependent hydrolase  81.64 
 
 		 361 aa  587  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1308  membrane-bound metal-dependent hydrolase  51.16 
 
 		 354 aa  323  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.458218 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34740  membrane-bound metal-dependent hydrolase  52.89 
 
 		 375 aa  320  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0683  membrane-bound metal-dependent hydrolase  45.51 
 
 		 357 aa  234  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3601  membrane-bound metal-dependent hydrolase  40.58 
 
 		 342 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0633  membrane-bound metal-dependent hydrolase  40.97 
 
 		 351 aa  203  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.153204 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01789  hypothetical protein  42.18 
 
 		 314 aa  186  7e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1842  membrane-bound metal-dependent hydrolase  40.24 
 
 		 375 aa  182  7e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251313 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2186  hypothetical protein  39 
 
 		 335 aa  175  8e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04870  hypothetical protein  37.25 
 
 		 334 aa  175  9e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499704  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1149  membrane-bound metal-dependent hydrolase  38.05 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3092  membrane-bound metal-dependent hydrolase  38.85 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00643925  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06039  hypothetical protein  30.1 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000244  integral membrane protein  29.49 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4246  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.08 
 
 		 351 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04685  integral membrane protein  53.47 
 
 		 162 aa  95.1  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0040  hypothetical protein  31.13 
 
 		 331 aa  94.4  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0041  hypothetical protein  30.65 
 
 		 331 aa  92.8  9e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0104  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.97 
 
 		 356 aa  90.1  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2955  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.44 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2821  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.72 
 
 		 349 aa  79  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0774774  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04684  hypothetical protein  34.21 
 
 		 203 aa  74.7  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1784  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.76 
 
 		 365 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.461872 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0089  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.33 
 
 		 347 aa  62.8  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0493  membrane-bound metal-dependent hydrolase  24.4 
 
 		 363 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1957  hypothetical protein  23.31 
 
 		 325 aa  53.9  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1923  hypothetical protein  23.31 
 
 		 325 aa  53.9  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0501  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.54 
 
 		 390 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.506044  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0189  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.41 
 
 		 358 aa  53.5  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0771  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.17 
 
 		 299 aa  52.8  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2345  membrane-bound metal-dependent hydrolase  24.08 
 
 		 341 aa  50.8  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000015243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1338  membrane-bound metal-dependent hydrolase  22.61 
 
 		 327 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1380  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.33 
 
 		 182 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0442  membrane-bound metal-dependent hydrolase  23.66 
 
 		 326 aa  45.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3150  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  45.8  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.552218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1266  putative metal-dependent hydrolase, membrane-bound  33.33 
 
 		 182 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1407  hypothetical protein  25.11 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0588  membrane-bound metal-dependent hydrolase  38.41 
 
 		 193 aa  44.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.455878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4023  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.41 
 
 		 183 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0577  yfhP protein  23.35 
 
 		 326 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0046526  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0433  hypothetical protein  23.35 
 
 		 326 aa  43.1  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000365967  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0524  yfhP protein  23.35 
 
 		 326 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00408838  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0429  hypothetical protein  23.35 
 
 		 326 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0576  yfhP protein  23.35 
 
 		 326 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0167875  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1546  membrane-bound metal-dependent hydrolase  24.04 
 
 		 319 aa  42.7  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0462  membrane-bound metal-dependent hydrolase  22.7 
 
 		 326 aa  42.7  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>