62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3601 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3601  membrane-bound metal-dependent hydrolase  100 
 
 
342 aa  681    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0683  membrane-bound metal-dependent hydrolase  48.49 
 
 
357 aa  277  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1308  membrane-bound metal-dependent hydrolase  48.17 
 
 
354 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.458218 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34740  membrane-bound metal-dependent hydrolase  47.89 
 
 
375 aa  240  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3169  membrane-bound metal-dependent hydrolase  41.28 
 
 
359 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2546  membrane-bound metal-dependent hydrolase  41.28 
 
 
359 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.355245  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2700  membrane-bound metal-dependent hydrolase  40.8 
 
 
361 aa  222  7e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2186  hypothetical protein  43.54 
 
 
335 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01789  hypothetical protein  39.47 
 
 
314 aa  210  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1842  membrane-bound metal-dependent hydrolase  39.81 
 
 
375 aa  203  4e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251313 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2680  membrane-bound metal-dependent hydrolase  40 
 
 
355 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0173837  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0633  membrane-bound metal-dependent hydrolase  39.27 
 
 
351 aa  178  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.153204 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04870  hypothetical protein  32.74 
 
 
334 aa  163  3e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499704  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3092  membrane-bound metal-dependent hydrolase  38.16 
 
 
342 aa  158  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00643925  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1149  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.8 
 
 
340 aa  156  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06039  hypothetical protein  30.53 
 
 
333 aa  87.8  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4246  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.71 
 
 
351 aa  83.6  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000244  integral membrane protein  29.19 
 
 
334 aa  83.2  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04685  integral membrane protein  51.02 
 
 
162 aa  80.9  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1784  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.92 
 
 
365 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.461872 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0040  hypothetical protein  30.51 
 
 
331 aa  76.3  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04684  hypothetical protein  28.47 
 
 
203 aa  75.9  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0104  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.45 
 
 
356 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0041  hypothetical protein  29.78 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2821  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.66 
 
 
349 aa  63.5  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0774774  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0089  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.95 
 
 
347 aa  57.8  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2955  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.28 
 
 
323 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0771  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.62 
 
 
299 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1338  membrane-bound metal-dependent hydrolase  24.84 
 
 
327 aa  49.7  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0442  membrane-bound metal-dependent hydrolase  23.83 
 
 
326 aa  48.9  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0501  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.6 
 
 
390 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.506044  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5691  inner membrane protein YbcI  41.94 
 
 
179 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1380  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.51 
 
 
182 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1266  putative metal-dependent hydrolase, membrane-bound  34.51 
 
 
182 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3150  hypothetical protein  34.51 
 
 
182 aa  45.4  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.552218  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0438  membrane-bound metal-dependent hydrolase  24.32 
 
 
326 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0429  hypothetical protein  23.78 
 
 
326 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00477  conserved inner membrane protein  37.84 
 
 
173 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.185455  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00482  hypothetical protein  37.84 
 
 
173 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.275959  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0433  hypothetical protein  23.78 
 
 
326 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000365967  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0576  yfhP protein  23.78 
 
 
326 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0167875  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3095  membrane-bound metal-dependent hydrolase  37.84 
 
 
173 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0342727  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0628  hypothetical protein  37.84 
 
 
173 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0247504  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0577  yfhP protein  23.78 
 
 
326 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0046526  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4800  yfhP protein  24.32 
 
 
326 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000384409  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0524  yfhP protein  24.32 
 
 
326 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00408838  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0462  membrane-bound metal-dependent hydrolase  23.12 
 
 
326 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0572  hypothetical protein  37.84 
 
 
173 aa  44.3  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0154428  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0502  yfhP protein  23.78 
 
 
326 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0447  hypothetical protein  37.84 
 
 
173 aa  44.7  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000487062  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0567  hypothetical protein  37.84 
 
 
173 aa  44.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000105687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0521  hypothetical protein  23.78 
 
 
326 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.724093  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0490  yfhP protein  23.78 
 
 
326 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2345  membrane-bound metal-dependent hydrolase  25.83 
 
 
341 aa  43.9  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000015243  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0602  hypothetical protein  40 
 
 
173 aa  43.5  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000045607  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3086  membrane-bound metal-dependent hydrolase  40 
 
 
173 aa  43.5  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000669215  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0588  inner membrane protein YbcI  34.83 
 
 
181 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.337402 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0648  hypothetical protein  34.83 
 
 
181 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0593  inner membrane protein YbcI  34.83 
 
 
181 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417884  normal  0.0138038 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0586  inner membrane protein YbcI  34.83 
 
 
181 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.150683  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0585  inner membrane protein YbcI  34.83 
 
 
181 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0279815 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0493  membrane-bound metal-dependent hydrolase  25.48 
 
 
363 aa  42.4  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>