36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0633 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0633  membrane-bound metal-dependent hydrolase  100 
 
 
351 aa  698    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.153204 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04684  hypothetical protein  64.04 
 
 
203 aa  235  9e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3169  membrane-bound metal-dependent hydrolase  41.89 
 
 
359 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2546  membrane-bound metal-dependent hydrolase  41.59 
 
 
359 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.355245  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2700  membrane-bound metal-dependent hydrolase  40.94 
 
 
361 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2186  hypothetical protein  44.34 
 
 
335 aa  203  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1308  membrane-bound metal-dependent hydrolase  38.3 
 
 
354 aa  202  6e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.458218 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0683  membrane-bound metal-dependent hydrolase  39.44 
 
 
357 aa  190  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2680  membrane-bound metal-dependent hydrolase  40.97 
 
 
355 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0173837  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34740  membrane-bound metal-dependent hydrolase  41.29 
 
 
375 aa  184  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04685  integral membrane protein  78.85 
 
 
162 aa  182  6e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01789  hypothetical protein  37.42 
 
 
314 aa  176  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3601  membrane-bound metal-dependent hydrolase  39.27 
 
 
342 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3092  membrane-bound metal-dependent hydrolase  40 
 
 
342 aa  162  6e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00643925  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1149  membrane-bound metal-dependent hydrolase  37.15 
 
 
340 aa  161  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1842  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.94 
 
 
375 aa  159  7e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251313 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04870  hypothetical protein  32.46 
 
 
334 aa  149  6e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499704  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000244  integral membrane protein  29.97 
 
 
334 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06039  hypothetical protein  30.13 
 
 
333 aa  94.4  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2821  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30 
 
 
349 aa  79.3  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0774774  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4246  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.18 
 
 
351 aa  75.9  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0104  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.32 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0040  hypothetical protein  25.66 
 
 
331 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0041  hypothetical protein  24.56 
 
 
331 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0089  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.33 
 
 
347 aa  61.6  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1784  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.21 
 
 
365 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.461872 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4651  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.34 
 
 
348 aa  53.9  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0493  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.01 
 
 
363 aa  52.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1546  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.6 
 
 
319 aa  49.7  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1957  hypothetical protein  26.47 
 
 
325 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1923  hypothetical protein  26.47 
 
 
325 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2345  membrane-bound metal-dependent hydrolase  24.08 
 
 
341 aa  46.2  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000015243  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0771  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.33 
 
 
299 aa  46.2  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1407  hypothetical protein  28.92 
 
 
324 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2241  hypothetical protein  33.85 
 
 
171 aa  43.9  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000136831  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2203  hypothetical protein  33.85 
 
 
171 aa  43.9  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00120723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>