30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1546 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1546  membrane-bound metal-dependent hydrolase  100 
 
 		 319 aa  636    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4651  membrane-bound metal-dependent hydrolase  38.12 
 
 		 348 aa  87  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0771  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.51 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2821  membrane-bound metal-dependent hydrolase  25.1 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0774774  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04870  hypothetical protein  25 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499704  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2345  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.98 
 
 		 341 aa  52  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000015243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2955  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.27 
 
 		 323 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0633  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.28 
 
 		 351 aa  46.2  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.153204 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2546  membrane-bound metal-dependent hydrolase  24.44 
 
 		 359 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.355245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2700  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.17 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0438  membrane-bound metal-dependent hydrolase  25.5 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1149  membrane-bound metal-dependent hydrolase  25.4 
 
 		 340 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0442  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.66 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1308  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.12 
 
 		 354 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.458218 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0683  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.77 
 
 		 357 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0577  yfhP protein  29.08 
 
 		 326 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0046526  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0493  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.4 
 
 		 363 aa  43.5  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0524  yfhP protein  29.86 
 
 		 326 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00408838  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0502  yfhP protein  29.08 
 
 		 326 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0490  yfhP protein  29.08 
 
 		 326 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2186  hypothetical protein  25.22 
 
 		 335 aa  43.9  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0521  hypothetical protein  29.08 
 
 		 326 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.724093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0429  hypothetical protein  29.08 
 
 		 326 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0433  hypothetical protein  29.08 
 
 		 326 aa  43.9  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000365967  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0576  yfhP protein  29.08 
 
 		 326 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0167875  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06039  hypothetical protein  29.05 
 
 		 333 aa  42.7  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01789  hypothetical protein  27.41 
 
 		 314 aa  42.7  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4800  yfhP protein  28.37 
 
 		 326 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000384409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1957  hypothetical protein  24.69 
 
 		 325 aa  42.7  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1923  hypothetical protein  24.69 
 
 		 325 aa  42.7  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>