40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2186 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2186  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  661    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3092  membrane-bound metal-dependent hydrolase  55.66 
 
 		 342 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00643925  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1149  membrane-bound metal-dependent hydrolase  49.12 
 
 		 340 aa  270  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3601  membrane-bound metal-dependent hydrolase  44.48 
 
 		 342 aa  206  5e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0633  membrane-bound metal-dependent hydrolase  44.03 
 
 		 351 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.153204 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34740  membrane-bound metal-dependent hydrolase  42.51 
 
 		 375 aa  199  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1308  membrane-bound metal-dependent hydrolase  42.31 
 
 		 354 aa  193  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.458218 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2700  membrane-bound metal-dependent hydrolase  39.74 
 
 		 361 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2546  membrane-bound metal-dependent hydrolase  37.18 
 
 		 359 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.355245  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3169  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.6 
 
 		 359 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01789  hypothetical protein  38.49 
 
 		 314 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04870  hypothetical protein  35.78 
 
 		 334 aa  177  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499704  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0683  membrane-bound metal-dependent hydrolase  39.41 
 
 		 357 aa  172  7.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2680  membrane-bound metal-dependent hydrolase  39 
 
 		 355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0173837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1842  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.25 
 
 		 375 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251313 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04684  hypothetical protein  36.16 
 
 		 203 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06039  hypothetical protein  27.81 
 
 		 333 aa  93.6  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1784  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.65 
 
 		 365 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.461872 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000244  integral membrane protein  28.43 
 
 		 334 aa  87.4  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4246  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.87 
 
 		 351 aa  79.3  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04685  integral membrane protein  45.37 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0104  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.76 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0089  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.05 
 
 		 347 aa  69.7  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0040  hypothetical protein  29.15 
 
 		 331 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0041  hypothetical protein  28.7 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2821  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.36 
 
 		 349 aa  65.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0774774  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0189  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.09 
 
 		 358 aa  59.7  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0396  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.6 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0877496 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0493  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.26 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1338  membrane-bound metal-dependent hydrolase  25.48 
 
 		 327 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0501  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.59 
 
 		 390 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.506044  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0462  membrane-bound metal-dependent hydrolase  23.9 
 
 		 326 aa  50.4  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1546  membrane-bound metal-dependent hydrolase  25.22 
 
 		 319 aa  48.9  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1407  hypothetical protein  27.33 
 
 		 324 aa  47  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1957  hypothetical protein  26.92 
 
 		 325 aa  47  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1923  hypothetical protein  26.92 
 
 		 325 aa  47  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0442  membrane-bound metal-dependent hydrolase  22.27 
 
 		 326 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4800  yfhP protein  20.82 
 
 		 326 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000384409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0521  hypothetical protein  20.5 
 
 		 326 aa  42.7  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.724093  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0490  yfhP protein  20.5 
 
 		 326 aa  42.7  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>