16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04684 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04684  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  410  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0633  membrane-bound metal-dependent hydrolase  64.04 
 
 
351 aa  235  4e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.153204 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2186  hypothetical protein  36.16 
 
 
335 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1842  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.85 
 
 
375 aa  89  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251313 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1149  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.97 
 
 
340 aa  87  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01789  hypothetical protein  28.9 
 
 
314 aa  85.9  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0683  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.33 
 
 
357 aa  82.8  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2546  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.78 
 
 
359 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.355245  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1308  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.34 
 
 
354 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.458218 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3169  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.9 
 
 
359 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3092  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.88 
 
 
342 aa  81.6  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00643925  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2700  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.82 
 
 
361 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3601  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.47 
 
 
342 aa  76.3  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34740  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.8 
 
 
375 aa  75.1  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2680  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.79 
 
 
355 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0173837  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04870  hypothetical protein  23.6 
 
 
334 aa  51.6  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>