51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3092 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3092  membrane-bound metal-dependent hydrolase  100 
 
 
342 aa  676    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00643925  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2186  hypothetical protein  55.62 
 
 
335 aa  330  3e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1149  membrane-bound metal-dependent hydrolase  56.66 
 
 
340 aa  293  4e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01789  hypothetical protein  38.64 
 
 
314 aa  190  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2700  membrane-bound metal-dependent hydrolase  39.2 
 
 
361 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34740  membrane-bound metal-dependent hydrolase  43 
 
 
375 aa  182  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0633  membrane-bound metal-dependent hydrolase  39.83 
 
 
351 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.153204 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3169  membrane-bound metal-dependent hydrolase  38.18 
 
 
359 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2546  membrane-bound metal-dependent hydrolase  37.84 
 
 
359 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.355245  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0683  membrane-bound metal-dependent hydrolase  41.21 
 
 
357 aa  172  5.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1308  membrane-bound metal-dependent hydrolase  40.79 
 
 
354 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.458218 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04870  hypothetical protein  33.73 
 
 
334 aa  166  8e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499704  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3601  membrane-bound metal-dependent hydrolase  38.93 
 
 
342 aa  159  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2680  membrane-bound metal-dependent hydrolase  39.06 
 
 
355 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0173837  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1842  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.22 
 
 
375 aa  142  7e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251313 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06039  hypothetical protein  32 
 
 
333 aa  97.4  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000244  integral membrane protein  32.47 
 
 
334 aa  94.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1784  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.02 
 
 
365 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.461872 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04684  hypothetical protein  35.88 
 
 
203 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4246  membrane-bound metal-dependent hydrolase  38.3 
 
 
351 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04685  integral membrane protein  47.06 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0089  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.58 
 
 
347 aa  72.8  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2821  membrane-bound metal-dependent hydrolase  25.82 
 
 
349 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0774774  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0041  hypothetical protein  32.4 
 
 
331 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0493  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.58 
 
 
363 aa  68.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0040  hypothetical protein  28.18 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1338  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.85 
 
 
327 aa  67  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0104  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.78 
 
 
356 aa  63.9  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0189  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.14 
 
 
358 aa  59.7  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1957  hypothetical protein  25.48 
 
 
325 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1923  hypothetical protein  25.48 
 
 
325 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0524  yfhP protein  22.44 
 
 
326 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00408838  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4800  yfhP protein  21.68 
 
 
326 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000384409  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0442  membrane-bound metal-dependent hydrolase  23.13 
 
 
326 aa  57  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0462  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.85 
 
 
326 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0576  yfhP protein  21.79 
 
 
326 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0167875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0429  hypothetical protein  21.79 
 
 
326 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0577  yfhP protein  21.79 
 
 
326 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0046526  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0433  hypothetical protein  21.79 
 
 
326 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000365967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0490  yfhP protein  21.79 
 
 
326 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0502  yfhP protein  21.79 
 
 
326 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0521  hypothetical protein  21.79 
 
 
326 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.724093  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0501  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.95 
 
 
390 aa  52.8  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.506044  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0396  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.86 
 
 
346 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0877496 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4651  membrane-bound metal-dependent hydrolase  25.63 
 
 
348 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0438  membrane-bound metal-dependent hydrolase  21.79 
 
 
326 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1407  hypothetical protein  30.2 
 
 
324 aa  49.3  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0771  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.58 
 
 
299 aa  46.6  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1546  membrane-bound metal-dependent hydrolase  24.32 
 
 
319 aa  45.8  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2345  membrane-bound metal-dependent hydrolase  23.02 
 
 
341 aa  43.9  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000015243  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2955  membrane-bound metal-dependent hydrolase  22.07 
 
 
323 aa  43.1  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>