51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1784 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1784  membrane-bound metal-dependent hydrolase  100 
 
 		 365 aa  729    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.461872 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0396  membrane-bound metal-dependent hydrolase  48.88 
 
 		 346 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0877496 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0501  membrane-bound metal-dependent hydrolase  39.06 
 
 		 390 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.506044  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2821  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.76 
 
 		 349 aa  103  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0774774  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2186  hypothetical protein  30.95 
 
 		 335 aa  87  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0493  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.24 
 
 		 363 aa  85.5  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0089  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.22 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04870  hypothetical protein  26.01 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499704  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01789  hypothetical protein  33.65 
 
 		 314 aa  82.8  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1149  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.77 
 
 		 340 aa  81.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1842  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.64 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251313 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1308  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.03 
 
 		 354 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.458218 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06039  hypothetical protein  26.84 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34740  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.63 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3092  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.02 
 
 		 342 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00643925  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3601  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.25 
 
 		 342 aa  76.6  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0189  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.33 
 
 		 358 aa  72.8  0.000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4246  membrane-bound metal-dependent hydrolase  37.27 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0683  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.2 
 
 		 357 aa  71.6  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3169  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.73 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2700  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.24 
 
 		 361 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2546  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.76 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.355245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1923  hypothetical protein  24 
 
 		 325 aa  67  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1957  hypothetical protein  24 
 
 		 325 aa  67  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0771  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.28 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000244  integral membrane protein  29.38 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0104  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.96 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1407  hypothetical protein  21.38 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0040  hypothetical protein  32.28 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0041  hypothetical protein  32.8 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0633  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.03 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.153204 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04685  integral membrane protein  36.67 
 
 		 162 aa  58.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4651  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.55 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2345  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.63 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000015243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2680  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.65 
 
 		 355 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0173837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2955  membrane-bound metal-dependent hydrolase  21.59 
 
 		 323 aa  54.3  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0438  membrane-bound metal-dependent hydrolase  21.61 
 
 		 326 aa  50.8  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0442  membrane-bound metal-dependent hydrolase  20.56 
 
 		 326 aa  50.8  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0524  yfhP protein  19.42 
 
 		 326 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00408838  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0502  yfhP protein  19.42 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1338  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.21 
 
 		 327 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4800  yfhP protein  19.06 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000384409  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0490  yfhP protein  19.42 
 
 		 326 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0521  hypothetical protein  19.42 
 
 		 326 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.724093  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0576  yfhP protein  25.78 
 
 		 326 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0167875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0429  hypothetical protein  19.06 
 
 		 326 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0433  hypothetical protein  25.78 
 
 		 326 aa  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000365967  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0577  yfhP protein  25.78 
 
 		 326 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0046526  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0462  membrane-bound metal-dependent hydrolase  22.1 
 
 		 326 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1546  membrane-bound metal-dependent hydrolase  25.21 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2503  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.61 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.472803  normal  0.438502 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>