54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01789 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01789  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  642    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1308  membrane-bound metal-dependent hydrolase  45.73 
 
 		 354 aa  219  5e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.458218 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34740  membrane-bound metal-dependent hydrolase  44.67 
 
 		 375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3601  membrane-bound metal-dependent hydrolase  38.38 
 
 		 342 aa  200  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2546  membrane-bound metal-dependent hydrolase  41.49 
 
 		 359 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.355245  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3169  membrane-bound metal-dependent hydrolase  41.49 
 
 		 359 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2700  membrane-bound metal-dependent hydrolase  40 
 
 		 361 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3092  membrane-bound metal-dependent hydrolase  38.64 
 
 		 342 aa  177  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00643925  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2186  hypothetical protein  38.49 
 
 		 335 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0683  membrane-bound metal-dependent hydrolase  40.12 
 
 		 357 aa  172  5.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0633  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.39 
 
 		 351 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.153204 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1149  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.39 
 
 		 340 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1842  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.97 
 
 		 375 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251313 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2680  membrane-bound metal-dependent hydrolase  42.18 
 
 		 355 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0173837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04870  hypothetical protein  31.09 
 
 		 334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499704  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04684  hypothetical protein  28.9 
 
 		 203 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4246  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.88 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06039  hypothetical protein  32.49 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1784  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.73 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.461872 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0104  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.94 
 
 		 356 aa  72  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04685  integral membrane protein  43.12 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000244  integral membrane protein  28.5 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2821  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.19 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0774774  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2955  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.37 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0493  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.58 
 
 		 363 aa  62  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0041  hypothetical protein  26.49 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0040  hypothetical protein  25.95 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1338  membrane-bound metal-dependent hydrolase  24.69 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0442  membrane-bound metal-dependent hydrolase  23.72 
 
 		 326 aa  55.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0438  membrane-bound metal-dependent hydrolase  23.92 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0089  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.05 
 
 		 347 aa  54.7  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0501  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.84 
 
 		 390 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.506044  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0521  hypothetical protein  22.12 
 
 		 326 aa  53.1  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.724093  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0490  yfhP protein  22.12 
 
 		 326 aa  53.1  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0771  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.94 
 
 		 299 aa  52.4  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4800  yfhP protein  22.22 
 
 		 326 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000384409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0502  yfhP protein  22.12 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0576  yfhP protein  22.12 
 
 		 326 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0167875  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0524  yfhP protein  21.89 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00408838  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0577  yfhP protein  21.63 
 
 		 326 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0046526  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0433  hypothetical protein  21.63 
 
 		 326 aa  51.2  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000365967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0429  hypothetical protein  21.15 
 
 		 326 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0462  membrane-bound metal-dependent hydrolase  22.73 
 
 		 326 aa  50.1  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2345  membrane-bound metal-dependent hydrolase  25.82 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000015243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1957  hypothetical protein  26.11 
 
 		 325 aa  46.2  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1923  hypothetical protein  26.11 
 
 		 325 aa  46.2  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1380  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.11 
 
 		 182 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3150  hypothetical protein  32.11 
 
 		 182 aa  45.4  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.552218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1266  putative metal-dependent hydrolase, membrane-bound  32.11 
 
 		 182 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5691  inner membrane protein YbcI  33.61 
 
 		 179 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0189  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.57 
 
 		 358 aa  44.3  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0396  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.92 
 
 		 346 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0877496 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0477  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.97 
 
 		 162 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1546  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.41 
 
 		 319 aa  42.7  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>