36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0462 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0462  membrane-bound metal-dependent hydrolase  100 
 
 
326 aa  669    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1338  membrane-bound metal-dependent hydrolase  74.54 
 
 
327 aa  511  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0576  yfhP protein  60.74 
 
 
326 aa  428  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0167875  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0502  yfhP protein  60.74 
 
 
326 aa  427  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0442  membrane-bound metal-dependent hydrolase  61.04 
 
 
326 aa  430  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0490  yfhP protein  60.74 
 
 
326 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0433  hypothetical protein  60.43 
 
 
326 aa  426  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000365967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0429  hypothetical protein  60.74 
 
 
326 aa  426  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0521  hypothetical protein  60.74 
 
 
326 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.724093  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0524  yfhP protein  60.12 
 
 
326 aa  425  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00408838  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0577  yfhP protein  60.43 
 
 
326 aa  426  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0046526  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4800  yfhP protein  59.82 
 
 
326 aa  423  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000384409  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0438  membrane-bound metal-dependent hydrolase  59.2 
 
 
326 aa  421  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1923  hypothetical protein  45.09 
 
 
325 aa  276  4e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1957  hypothetical protein  45.09 
 
 
325 aa  276  4e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1407  hypothetical protein  44.62 
 
 
324 aa  265  7e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2955  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.05 
 
 
323 aa  90.5  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2345  membrane-bound metal-dependent hydrolase  22.84 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000015243  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0771  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.77 
 
 
299 aa  63.2  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1149  membrane-bound metal-dependent hydrolase  22.19 
 
 
340 aa  58.5  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4651  membrane-bound metal-dependent hydrolase  24.24 
 
 
348 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2821  membrane-bound metal-dependent hydrolase  24.4 
 
 
349 aa  58.9  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0774774  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1842  membrane-bound metal-dependent hydrolase  25.71 
 
 
375 aa  57.4  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251313 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0493  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.37 
 
 
363 aa  52.8  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01789  hypothetical protein  22.73 
 
 
314 aa  50.1  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06039  hypothetical protein  26.05 
 
 
333 aa  49.3  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000244  integral membrane protein  22.19 
 
 
334 aa  47.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34740  membrane-bound metal-dependent hydrolase  23.88 
 
 
375 aa  47  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0477  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.61 
 
 
162 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2186  hypothetical protein  23.08 
 
 
335 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0089  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.45 
 
 
347 aa  45.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04870  hypothetical protein  29.93 
 
 
334 aa  43.9  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499704  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3169  membrane-bound metal-dependent hydrolase  22.88 
 
 
359 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4246  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.66 
 
 
351 aa  42.7  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2700  membrane-bound metal-dependent hydrolase  22.16 
 
 
361 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0104  membrane-bound metal-dependent hydrolase  23.71 
 
 
356 aa  42.4  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>