40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4246 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4246  membrane-bound metal-dependent hydrolase  100 
 
 		 351 aa  697    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0104  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.84 
 
 		 356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000244  integral membrane protein  36.01 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06039  hypothetical protein  34.19 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0040  hypothetical protein  33.01 
 
 		 331 aa  148  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0041  hypothetical protein  32.36 
 
 		 331 aa  146  5e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2546  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.61 
 
 		 359 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.355245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2700  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.57 
 
 		 361 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3169  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.52 
 
 		 359 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34740  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.71 
 
 		 375 aa  110  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04870  hypothetical protein  26.06 
 
 		 334 aa  99  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499704  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0683  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.51 
 
 		 357 aa  95.5  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2680  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.32 
 
 		 355 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0173837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1308  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.91 
 
 		 354 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.458218 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2186  hypothetical protein  34.23 
 
 		 335 aa  89  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3601  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.71 
 
 		 342 aa  87.4  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2821  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.53 
 
 		 349 aa  87  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0774774  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01789  hypothetical protein  29.88 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1149  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.01 
 
 		 340 aa  80.9  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1842  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30 
 
 		 375 aa  80.1  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251313 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3092  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.22 
 
 		 342 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00643925  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0633  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.06 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.153204 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1784  membrane-bound metal-dependent hydrolase  37.34 
 
 		 365 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.461872 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0089  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.13 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4651  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.26 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0501  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.91 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.506044  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2345  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.47 
 
 		 341 aa  54.7  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000015243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04685  integral membrane protein  38.89 
 
 		 162 aa  53.5  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2955  membrane-bound metal-dependent hydrolase  25.73 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0396  membrane-bound metal-dependent hydrolase  38.97 
 
 		 346 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0877496 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1338  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.63 
 
 		 327 aa  49.7  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1957  hypothetical protein  27.36 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1923  hypothetical protein  27.36 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0493  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.08 
 
 		 363 aa  47.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0771  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.69 
 
 		 299 aa  46.6  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1407  hypothetical protein  29.03 
 
 		 324 aa  46.2  0.0009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0588  membrane-bound metal-dependent hydrolase  37.04 
 
 		 193 aa  44.3  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.455878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0189  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.68 
 
 		 358 aa  44.3  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2194  hypothetical protein  37.84 
 
 		 191 aa  43.9  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0462  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.66 
 
 		 326 aa  42.7  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>