40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0041 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0041  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  681    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0040  hypothetical protein  97.58 
 
 
331 aa  645    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06039  hypothetical protein  32.65 
 
 
333 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0104  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.11 
 
 
356 aa  169  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000244  integral membrane protein  32.27 
 
 
334 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4246  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.9 
 
 
351 aa  153  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2700  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.13 
 
 
361 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2546  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.1 
 
 
359 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.355245  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3169  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.8 
 
 
359 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2821  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.08 
 
 
349 aa  95.9  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0774774  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2680  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.75 
 
 
355 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0173837  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34740  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.88 
 
 
375 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0683  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.76 
 
 
357 aa  84.3  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04870  hypothetical protein  37.41 
 
 
334 aa  84.3  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499704  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1308  membrane-bound metal-dependent hydrolase  24.84 
 
 
354 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.458218 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3601  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.78 
 
 
342 aa  75.1  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1842  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.96 
 
 
375 aa  74.3  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251313 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01789  hypothetical protein  26.49 
 
 
314 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2186  hypothetical protein  28.7 
 
 
335 aa  68.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3092  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.43 
 
 
342 aa  67  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00643925  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0089  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.82 
 
 
347 aa  66.6  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1784  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.97 
 
 
365 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.461872 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2955  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.88 
 
 
323 aa  63.9  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0633  membrane-bound metal-dependent hydrolase  24.56 
 
 
351 aa  63.2  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.153204 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1149  membrane-bound metal-dependent hydrolase  25.08 
 
 
340 aa  62.4  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0493  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.48 
 
 
363 aa  61.6  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04685  integral membrane protein  35.58 
 
 
162 aa  53.1  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0396  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.26 
 
 
346 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0877496 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2345  membrane-bound metal-dependent hydrolase  24.14 
 
 
341 aa  47.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000015243  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4651  membrane-bound metal-dependent hydrolase  25.32 
 
 
348 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0462  membrane-bound metal-dependent hydrolase  25.53 
 
 
326 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0477  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.88 
 
 
162 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0189  membrane-bound metal-dependent hydrolase  25.23 
 
 
358 aa  44.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3112  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.04 
 
 
196 aa  44.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1923  hypothetical protein  25 
 
 
325 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5691  inner membrane protein YbcI  36.08 
 
 
179 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1957  hypothetical protein  25 
 
 
325 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0588  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.33 
 
 
193 aa  43.9  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.455878  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0501  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.58 
 
 
390 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.506044  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0571  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.14 
 
 
196 aa  43.1  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.240779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>