41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1338 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1338  membrane-bound metal-dependent hydrolase  100 
 
 
327 aa  668    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0462  membrane-bound metal-dependent hydrolase  74.54 
 
 
326 aa  511  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0576  yfhP protein  59.51 
 
 
326 aa  414  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0167875  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0490  yfhP protein  59.82 
 
 
326 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0521  hypothetical protein  59.82 
 
 
326 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.724093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0502  yfhP protein  59.82 
 
 
326 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0524  yfhP protein  59.2 
 
 
326 aa  414  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00408838  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0433  hypothetical protein  59.2 
 
 
326 aa  411  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000365967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0429  hypothetical protein  59.51 
 
 
326 aa  412  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4800  yfhP protein  58.9 
 
 
326 aa  411  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000384409  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0577  yfhP protein  59.2 
 
 
326 aa  411  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0046526  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0438  membrane-bound metal-dependent hydrolase  58.9 
 
 
326 aa  413  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0442  membrane-bound metal-dependent hydrolase  58.28 
 
 
326 aa  409  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1407  hypothetical protein  43.08 
 
 
324 aa  255  7e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1923  hypothetical protein  40.92 
 
 
325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1957  hypothetical protein  40.92 
 
 
325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2955  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.16 
 
 
323 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0771  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.99 
 
 
299 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2345  membrane-bound metal-dependent hydrolase  23.95 
 
 
341 aa  79  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000015243  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2821  membrane-bound metal-dependent hydrolase  22.5 
 
 
349 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0774774  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4651  membrane-bound metal-dependent hydrolase  23.72 
 
 
348 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0493  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.73 
 
 
363 aa  57  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01789  hypothetical protein  24.69 
 
 
314 aa  57.4  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0089  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.87 
 
 
347 aa  54.7  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1149  membrane-bound metal-dependent hydrolase  23.66 
 
 
340 aa  53.5  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0189  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.1 
 
 
358 aa  52.4  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1842  membrane-bound metal-dependent hydrolase  23.64 
 
 
375 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251313 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06039  hypothetical protein  27.62 
 
 
333 aa  51.2  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34740  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.85 
 
 
375 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04870  hypothetical protein  30.56 
 
 
334 aa  50.8  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499704  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3092  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.85 
 
 
342 aa  50.1  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00643925  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4246  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.3 
 
 
351 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0396  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.91 
 
 
346 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0877496 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000244  integral membrane protein  23.51 
 
 
334 aa  47.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0501  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34 
 
 
390 aa  47  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.506044  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3169  membrane-bound metal-dependent hydrolase  23.57 
 
 
359 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2546  membrane-bound metal-dependent hydrolase  23.25 
 
 
359 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.355245  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1784  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.06 
 
 
365 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.461872 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2186  hypothetical protein  25.48 
 
 
335 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2700  membrane-bound metal-dependent hydrolase  22.57 
 
 
361 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0477  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.51 
 
 
162 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>