45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1149 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1149  membrane-bound metal-dependent hydrolase  100 
 
 		 340 aa  667    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2186  hypothetical protein  49.12 
 
 		 335 aa  276  5e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3092  membrane-bound metal-dependent hydrolase  56.66 
 
 		 342 aa  275  5e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00643925  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3169  membrane-bound metal-dependent hydrolase  38.95 
 
 		 359 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2546  membrane-bound metal-dependent hydrolase  40.07 
 
 		 359 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.355245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2700  membrane-bound metal-dependent hydrolase  38.75 
 
 		 361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34740  membrane-bound metal-dependent hydrolase  40.66 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1308  membrane-bound metal-dependent hydrolase  37.54 
 
 		 354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.458218 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0683  membrane-bound metal-dependent hydrolase  38.08 
 
 		 357 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2680  membrane-bound metal-dependent hydrolase  38.05 
 
 		 355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0173837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01789  hypothetical protein  36.57 
 
 		 314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0633  membrane-bound metal-dependent hydrolase  37.15 
 
 		 351 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.153204 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3601  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.39 
 
 		 342 aa  151  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04870  hypothetical protein  31.98 
 
 		 334 aa  149  6e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499704  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1842  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.24 
 
 		 375 aa  139  6e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251313 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06039  hypothetical protein  31.83 
 
 		 333 aa  105  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0104  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.08 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04684  hypothetical protein  34.97 
 
 		 203 aa  87.4  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000244  integral membrane protein  28.2 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0089  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.06 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2821  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.25 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0774774  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1784  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.07 
 
 		 365 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.461872 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4246  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.22 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0041  hypothetical protein  26.42 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0040  hypothetical protein  26.09 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0189  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.29 
 
 		 358 aa  60.5  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0462  membrane-bound metal-dependent hydrolase  22.19 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1338  membrane-bound metal-dependent hydrolase  24.59 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0493  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.67 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04685  integral membrane protein  40.91 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1957  hypothetical protein  27.15 
 
 		 325 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1923  hypothetical protein  27.15 
 
 		 325 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0396  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.12 
 
 		 346 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0877496 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0501  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.88 
 
 		 390 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.506044  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1407  hypothetical protein  26.42 
 
 		 324 aa  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1546  membrane-bound metal-dependent hydrolase  25.4 
 
 		 319 aa  47.8  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0438  membrane-bound metal-dependent hydrolase  24.17 
 
 		 326 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0442  membrane-bound metal-dependent hydrolase  22.02 
 
 		 326 aa  43.5  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0502  yfhP protein  22.75 
 
 		 326 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4800  yfhP protein  22.75 
 
 		 326 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000384409  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0576  yfhP protein  22.75 
 
 		 326 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0167875  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0433  hypothetical protein  22.75 
 
 		 326 aa  42.7  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000365967  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0577  yfhP protein  22.75 
 
 		 326 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0046526  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0429  hypothetical protein  22.75 
 
 		 326 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0524  yfhP protein  23.26 
 
 		 326 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00408838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>