32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04685 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04685  integral membrane protein  100 
 
 		 162 aa  315  2e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0633  membrane-bound metal-dependent hydrolase  78.85 
 
 		 351 aa  221  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.153204 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3169  membrane-bound metal-dependent hydrolase  53.38 
 
 		 359 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2546  membrane-bound metal-dependent hydrolase  52.7 
 
 		 359 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.355245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1308  membrane-bound metal-dependent hydrolase  52.83 
 
 		 354 aa  128  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.458218 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2700  membrane-bound metal-dependent hydrolase  50.33 
 
 		 361 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34740  membrane-bound metal-dependent hydrolase  50 
 
 		 375 aa  121  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2680  membrane-bound metal-dependent hydrolase  51.33 
 
 		 355 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0173837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04870  hypothetical protein  44.16 
 
 		 334 aa  105  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499704  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0683  membrane-bound metal-dependent hydrolase  47.71 
 
 		 357 aa  102  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3601  membrane-bound metal-dependent hydrolase  50.34 
 
 		 342 aa  96.3  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2186  hypothetical protein  45.51 
 
 		 335 aa  90.5  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01789  hypothetical protein  44.09 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06039  hypothetical protein  35 
 
 		 333 aa  80.5  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3092  membrane-bound metal-dependent hydrolase  48.7 
 
 		 342 aa  79.7  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00643925  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000244  integral membrane protein  35.21 
 
 		 334 aa  76.3  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1149  membrane-bound metal-dependent hydrolase  41.72 
 
 		 340 aa  75.5  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1842  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.02 
 
 		 375 aa  73.9  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251313 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0104  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2821  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.78 
 
 		 349 aa  71.6  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0774774  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0041  hypothetical protein  36.42 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0040  hypothetical protein  35.57 
 
 		 331 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1784  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.3 
 
 		 365 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.461872 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0493  membrane-bound metal-dependent hydrolase  37.07 
 
 		 363 aa  58.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0089  membrane-bound metal-dependent hydrolase  39.19 
 
 		 347 aa  58.2  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4246  membrane-bound metal-dependent hydrolase  37.58 
 
 		 351 aa  57  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1407  hypothetical protein  32.41 
 
 		 324 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1546  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.9 
 
 		 319 aa  45.1  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4651  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.97 
 
 		 348 aa  44.7  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1957  hypothetical protein  28.75 
 
 		 325 aa  43.9  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1923  hypothetical protein  28.75 
 
 		 325 aa  43.9  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0771  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.46 
 
 		 299 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>