38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000244 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000244  integral membrane protein  100 
 
 		 334 aa  692    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06039  hypothetical protein  66.06 
 
 		 333 aa  483  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0104  membrane-bound metal-dependent hydrolase  43.07 
 
 		 356 aa  267  2e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4246  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.27 
 
 		 351 aa  181  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0040  hypothetical protein  32.81 
 
 		 331 aa  156  4e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0041  hypothetical protein  32.27 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2700  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.86 
 
 		 361 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2546  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.2 
 
 		 359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.355245  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3169  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.53 
 
 		 359 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2680  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.15 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0173837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1308  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.48 
 
 		 354 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.458218 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04870  hypothetical protein  27.39 
 
 		 334 aa  103  6e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499704  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0633  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.97 
 
 		 351 aa  98.2  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.153204 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2821  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.77 
 
 		 349 aa  96.7  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0774774  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34740  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.03 
 
 		 375 aa  92  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0683  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.79 
 
 		 357 aa  91.3  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2186  hypothetical protein  29.43 
 
 		 335 aa  87.8  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3092  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.05 
 
 		 342 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00643925  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1149  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.87 
 
 		 340 aa  81.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1842  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.14 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251313 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3601  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.2 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4651  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.31 
 
 		 348 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01789  hypothetical protein  28.5 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0089  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.26 
 
 		 347 aa  73.9  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2345  membrane-bound metal-dependent hydrolase  24.51 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000015243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1957  hypothetical protein  24.16 
 
 		 325 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1923  hypothetical protein  24.16 
 
 		 325 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04685  integral membrane protein  35.19 
 
 		 162 aa  64.3  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1407  hypothetical protein  25.41 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2955  membrane-bound metal-dependent hydrolase  23.76 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1784  membrane-bound metal-dependent hydrolase  24.46 
 
 		 365 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.461872 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0396  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.4 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0877496 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0493  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.49 
 
 		 363 aa  53.9  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0501  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.7 
 
 		 390 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.506044  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0462  membrane-bound metal-dependent hydrolase  22.37 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1338  membrane-bound metal-dependent hydrolase  23.51 
 
 		 327 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0189  membrane-bound metal-dependent hydrolase  25.09 
 
 		 358 aa  45.8  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0576  yfhP protein  21.81 
 
 		 326 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0167875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>