48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2955 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2955  membrane-bound metal-dependent hydrolase  100 
 
 
323 aa  666    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2345  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.61 
 
 
341 aa  132  9e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000015243  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1338  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.16 
 
 
327 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0462  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.05 
 
 
326 aa  90.5  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4800  yfhP protein  22.87 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000384409  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2546  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.24 
 
 
359 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.355245  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0433  hypothetical protein  22.7 
 
 
326 aa  77  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000365967  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0577  yfhP protein  22.7 
 
 
326 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0046526  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0576  yfhP protein  22.64 
 
 
326 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0167875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0429  hypothetical protein  22.37 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0502  yfhP protein  22.7 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3169  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.39 
 
 
359 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0524  yfhP protein  21.93 
 
 
326 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00408838  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0521  hypothetical protein  22.37 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.724093  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0490  yfhP protein  22.37 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0442  membrane-bound metal-dependent hydrolase  22.57 
 
 
326 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0438  membrane-bound metal-dependent hydrolase  23.57 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2700  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.57 
 
 
361 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06039  hypothetical protein  34.51 
 
 
333 aa  66.6  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4651  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.09 
 
 
348 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0040  hypothetical protein  32.35 
 
 
331 aa  63.2  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01789  hypothetical protein  26.37 
 
 
314 aa  63.5  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0041  hypothetical protein  30.88 
 
 
331 aa  60.1  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1407  hypothetical protein  22.12 
 
 
324 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1842  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.5 
 
 
375 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251313 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000244  integral membrane protein  23.1 
 
 
334 aa  56.6  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1957  hypothetical protein  23.66 
 
 
325 aa  56.6  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1923  hypothetical protein  23.66 
 
 
325 aa  56.6  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1308  membrane-bound metal-dependent hydrolase  25.81 
 
 
354 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.458218 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2680  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.61 
 
 
355 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0173837  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34740  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.47 
 
 
375 aa  55.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0771  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.75 
 
 
299 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1784  membrane-bound metal-dependent hydrolase  21.27 
 
 
365 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.461872 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0089  membrane-bound metal-dependent hydrolase  25.79 
 
 
347 aa  52.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0104  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.94 
 
 
356 aa  52  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0189  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.17 
 
 
358 aa  48.9  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04870  hypothetical protein  28.93 
 
 
334 aa  48.5  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499704  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1546  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.27 
 
 
319 aa  48.5  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0923  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.86 
 
 
187 aa  47.8  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010004  normal  0.0304863 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2821  membrane-bound metal-dependent hydrolase  22.63 
 
 
349 aa  47  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0774774  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3601  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.11 
 
 
342 aa  45.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4246  membrane-bound metal-dependent hydrolase  24.44 
 
 
351 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1901  hypothetical protein  33 
 
 
191 aa  44.3  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0477  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.93 
 
 
162 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0707  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.75 
 
 
164 aa  43.5  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0929969  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2194  hypothetical protein  33 
 
 
191 aa  43.5  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1532  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.27 
 
 
168 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000376224  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0493  membrane-bound metal-dependent hydrolase  25.16 
 
 
363 aa  43.1  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>