55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1901 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1901  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  392  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2194  hypothetical protein  95.81 
 
 		 191 aa  380  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1963  hypothetical protein  74.47 
 
 		 192 aa  287  6e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.175154  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2124  hypothetical protein  75.16 
 
 		 182 aa  261  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000163059  hitchhiker  0.000408284 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1686  hypothetical protein  66.29 
 
 		 182 aa  249  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0482652  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2650  hypothetical protein  66.29 
 
 		 182 aa  249  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.141384  normal  0.0513814 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1796  hypothetical protein  66.29 
 
 		 182 aa  249  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01685  hypothetical protein  61.26 
 
 		 196 aa  246  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.540311  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2446  hypothetical protein  61.26 
 
 		 196 aa  246  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01697  predicted inner membrane protein regulated by LexA  61.26 
 
 		 196 aa  246  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1904  hypothetical protein  61.26 
 
 		 196 aa  246  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.727123 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1463  hypothetical protein  61.26 
 
 		 196 aa  246  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1973  hypothetical protein  61.26 
 
 		 196 aa  245  3e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1949  hypothetical protein  61.26 
 
 		 196 aa  245  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1809  hypothetical protein  61.26 
 
 		 196 aa  245  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1914  membrane-bound metal-dependent hydrolase  61.26 
 
 		 196 aa  245  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.109701  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1435  hypothetical protein  68.48 
 
 		 199 aa  241  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1418  hypothetical protein  68.48 
 
 		 199 aa  241  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.597703  normal  0.0132689 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1850  hypothetical protein  68.48 
 
 		 199 aa  241  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00111152  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2023  hypothetical protein  68.48 
 
 		 199 aa  241  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1450  hypothetical protein  68.48 
 
 		 199 aa  240  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1715  hypothetical protein  67.07 
 
 		 196 aa  240  9e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.28693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2203  hypothetical protein  36.03 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00120723  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2241  hypothetical protein  36.03 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000136831  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1532  membrane-bound metal-dependent hydrolase  37.4 
 
 		 168 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000376224  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1771  hypothetical protein  35.25 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4186  membrane-bound metal-dependent hydrolase  41.67 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.495485  normal  0.485593 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2634  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.92 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0707  membrane-bound metal-dependent hydrolase  40.95 
 
 		 164 aa  70.9  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0929969  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0932  membrane-bound metal-dependent hydrolase  39.22 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0842  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.69 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0032  membrane-bound metal-dependent hydrolase  38.41 
 
 		 368 aa  65.9  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0323  membrane-bound metal-dependent hydrolase  38.46 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00272599  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1028  putative metal-dependent hydrolase, membrane-bound  33.04 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.508363  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1912  nuclease (SNase-like)  40.15 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183465  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2446  membrane-bound metal-dependent hydrolase  40.91 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1203  putative metal-dependent hydrolase, membrane-bound  32.14 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000395811  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  38.24 
 
 		 324 aa  58.2  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2560  membrane-bound metal-dependent hydrolase  37.93 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00663072  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0310  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.82 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0109  hypothetical protein  32.61 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0075  hypothetical protein  29.29 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3120  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.57 
 
 		 239 aa  48.9  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163778  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4627  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.14 
 
 		 347 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6744  hypothetical protein  27.75 
 
 		 242 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019291  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2176  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.78 
 
 		 235 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3301  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.86 
 
 		 130 aa  45.1  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2277  membrane-bound metal-dependent hydrolase  24.22 
 
 		 240 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273545  normal  0.123352 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1445  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.07 
 
 		 279 aa  44.3  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2955  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33 
 
 		 323 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2133  membrane-bound metal-dependent hydrolase  25.9 
 
 		 238 aa  43.1  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0192  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.75 
 
 		 291 aa  42.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.353069  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0923  membrane-bound metal-dependent hydrolase  25.95 
 
 		 187 aa  42.7  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010004  normal  0.0304863 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4246  membrane-bound metal-dependent hydrolase  40 
 
 		 351 aa  42.4  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4895  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.42 
 
 		 345 aa  41.6  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>