59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2277 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2277  membrane-bound metal-dependent hydrolase  100 
 
 		 240 aa  471  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273545  normal  0.123352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6744  hypothetical protein  60.91 
 
 		 242 aa  291  5e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019291  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0630  membrane-bound metal-dependent hydrolase  44.3 
 
 		 237 aa  178  7e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00076162  normal  0.281014 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0967  putative integral membrane protein  43.15 
 
 		 237 aa  169  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416011  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2133  membrane-bound metal-dependent hydrolase  42.24 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3120  membrane-bound metal-dependent hydrolase  41.35 
 
 		 239 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163778  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2176  membrane-bound metal-dependent hydrolase  40.69 
 
 		 235 aa  132  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8859  membrane-bound metal-dependent hydrolase  39.83 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6479  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.57 
 
 		 268 aa  119  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3201  membrane-bound metal-dependent hydrolase  38.89 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0757158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2977  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.23 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.48433  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1445  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.73 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0192  membrane-bound metal-dependent hydrolase  37.62 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.353069  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5590  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.62 
 
 		 242 aa  97.1  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5807  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.7 
 
 		 277 aa  94.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.940742 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4226  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.97 
 
 		 285 aa  92.8  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22930  putative membrane-bound metal-dependent hydrolase  37.65 
 
 		 256 aa  88.6  7e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1299  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.72 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000344983 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4172  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.05 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34910  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  31.78 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.199547 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1246  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.87 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.482116  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0035  putative integral membrane protein  34.84 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.995493  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0212  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.67 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0013  putative integral membrane protein  30.88 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.287986  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06660  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  36.53 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17380  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  35.07 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.096354 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1129  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.42 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1373  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.55 
 
 		 261 aa  52.8  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275963 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1554  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.6 
 
 		 224 aa  50.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2446  membrane-bound metal-dependent hydrolase  44.23 
 
 		 156 aa  50.1  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1123  membrane-bound metal-dependent hydrolase  25 
 
 		 224 aa  49.7  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2650  hypothetical protein  25.29 
 
 		 182 aa  48.5  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.141384  normal  0.0513814 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1796  hypothetical protein  25.29 
 
 		 182 aa  48.5  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1686  hypothetical protein  25.29 
 
 		 182 aa  48.5  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0482652  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2124  hypothetical protein  26.38 
 
 		 182 aa  48.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000163059  hitchhiker  0.000408284 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1715  hypothetical protein  24.73 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.28693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0828  membrane-bound metal-dependent hydrolase  25 
 
 		 224 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2446  hypothetical protein  26.71 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2194  hypothetical protein  24.71 
 
 		 191 aa  47  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01685  hypothetical protein  26.71 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.540311  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01697  predicted inner membrane protein regulated by LexA  26.71 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1901  hypothetical protein  24.71 
 
 		 191 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1463  hypothetical protein  26.71 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1904  hypothetical protein  26.71 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.727123 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1450  hypothetical protein  26.71 
 
 		 199 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2023  hypothetical protein  26.71 
 
 		 199 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1850  hypothetical protein  26.71 
 
 		 199 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00111152  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1418  hypothetical protein  26.71 
 
 		 199 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.597703  normal  0.0132689 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1435  hypothetical protein  26.71 
 
 		 199 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1973  hypothetical protein  26.09 
 
 		 196 aa  45.4  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1949  hypothetical protein  26.09 
 
 		 196 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1809  hypothetical protein  26.09 
 
 		 196 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1914  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.09 
 
 		 196 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.109701  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0932  membrane-bound metal-dependent hydrolase  25.33 
 
 		 149 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0571  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.11 
 
 		 196 aa  43.5  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.240779  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4186  membrane-bound metal-dependent hydrolase  39.06 
 
 		 117 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.495485  normal  0.485593 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1963  hypothetical protein  25.9 
 
 		 192 aa  43.1  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.175154  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3112  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.51 
 
 		 196 aa  42.4  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0844  membrane-bound metal-dependent hydrolase  39.68 
 
 		 180 aa  41.6  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>