23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3201 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3201  membrane-bound metal-dependent hydrolase  100 
 
 		 269 aa  534  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0757158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2977  membrane-bound metal-dependent hydrolase  94.4 
 
 		 269 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.48433  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5807  membrane-bound metal-dependent hydrolase  52.32 
 
 		 277 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.940742 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6479  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.7 
 
 		 268 aa  145  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5590  membrane-bound metal-dependent hydrolase  37.26 
 
 		 242 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0630  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.55 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00076162  normal  0.281014 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34910  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  34.32 
 
 		 254 aa  89.7  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.199547 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0967  putative integral membrane protein  33.46 
 
 		 237 aa  88.6  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416011  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2277  membrane-bound metal-dependent hydrolase  38.89 
 
 		 240 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273545  normal  0.123352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6744  hypothetical protein  30.08 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019291  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0192  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.98 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.353069  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0013  putative integral membrane protein  33.98 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.287986  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2133  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.62 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2176  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.7 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3120  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.08 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163778  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8859  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.32 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1445  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17380  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  32.81 
 
 		 272 aa  53.5  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.096354 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4226  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.05 
 
 		 285 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1373  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.58 
 
 		 261 aa  49.7  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275963 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1299  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.1 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000344983 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1246  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.36 
 
 		 274 aa  47  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.482116  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0842  membrane-bound metal-dependent hydrolase  54.29 
 
 		 163 aa  46.2  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>