26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1373 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1373  membrane-bound metal-dependent hydrolase  100 
 
 
261 aa  478  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275963 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5590  membrane-bound metal-dependent hydrolase  42.02 
 
 
242 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0013  putative integral membrane protein  40.5 
 
 
252 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.287986  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3201  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.5 
 
 
269 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0757158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2977  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.73 
 
 
269 aa  96.3  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.48433  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5807  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.98 
 
 
277 aa  95.5  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.940742 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2277  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.74 
 
 
240 aa  94.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273545  normal  0.123352 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6479  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.24 
 
 
268 aa  92.8  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6744  hypothetical protein  32.81 
 
 
242 aa  92  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019291  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34910  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  37.29 
 
 
254 aa  91.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.199547 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0630  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.7 
 
 
237 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00076162  normal  0.281014 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0967  putative integral membrane protein  31.54 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416011  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1445  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.96 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2133  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.5 
 
 
238 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0192  membrane-bound metal-dependent hydrolase  38.18 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.353069  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3120  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.54 
 
 
239 aa  72.8  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163778  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22930  putative membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.57 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2176  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.17 
 
 
235 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8859  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.14 
 
 
240 aa  59.3  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4226  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.27 
 
 
285 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1299  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.11 
 
 
271 aa  53.1  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000344983 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17380  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  50.75 
 
 
272 aa  51.6  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.096354 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06660  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  33.33 
 
 
260 aa  50.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1246  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.05 
 
 
274 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.482116  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2446  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.36 
 
 
156 aa  47  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0844  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.36 
 
 
180 aa  42.7  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>