23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0013 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0013  putative integral membrane protein  100 
 
 		 252 aa  480  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.287986  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5590  membrane-bound metal-dependent hydrolase  41.73 
 
 		 242 aa  125  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6479  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.48 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34910  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  37.96 
 
 		 254 aa  92.8  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.199547 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3201  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.98 
 
 		 269 aa  85.9  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0757158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5807  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.44 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.940742 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2977  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.17 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.48433  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0630  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.02 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00076162  normal  0.281014 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1373  membrane-bound metal-dependent hydrolase  40.64 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275963 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2277  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.84 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273545  normal  0.123352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2176  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.46 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6744  hypothetical protein  29.26 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019291  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17380  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  35.81 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.096354 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2133  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.2 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0967  putative integral membrane protein  32.71 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416011  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22930  putative membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.92 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0192  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.13 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.353069  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8859  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.63 
 
 		 240 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1445  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.57 
 
 		 279 aa  52  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4226  membrane-bound metal-dependent hydrolase  25 
 
 		 285 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1299  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.2 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000344983 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0212  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.18 
 
 		 266 aa  43.9  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0035  putative integral membrane protein  33.17 
 
 		 236 aa  42  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.995493  normal  0.0275677 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>