29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8859 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8859  membrane-bound metal-dependent hydrolase  100 
 
 
240 aa  481  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6744  hypothetical protein  35.22 
 
 
242 aa  125  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019291  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2133  membrane-bound metal-dependent hydrolase  37.7 
 
 
238 aa  120  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2277  membrane-bound metal-dependent hydrolase  39.83 
 
 
240 aa  119  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273545  normal  0.123352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2176  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35 
 
 
235 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3120  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.27 
 
 
239 aa  106  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163778  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0192  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.6 
 
 
291 aa  102  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.353069  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4226  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.57 
 
 
285 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22930  putative membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.49 
 
 
256 aa  98.6  7e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1445  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.29 
 
 
279 aa  95.1  9e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0630  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.77 
 
 
237 aa  92.4  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00076162  normal  0.281014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6479  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.6 
 
 
268 aa  89.4  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5590  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.91 
 
 
242 aa  82.8  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1299  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.19 
 
 
271 aa  82.8  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000344983 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1246  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.09 
 
 
274 aa  78.6  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.482116  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0967  putative integral membrane protein  28.57 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416011  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17380  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  30.99 
 
 
272 aa  76.3  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.096354 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0212  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.77 
 
 
266 aa  75.5  0.0000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34910  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  32.03 
 
 
254 aa  74.7  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.199547 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4172  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2977  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.67 
 
 
269 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.48433  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3201  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.04 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0757158 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06660  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  33.76 
 
 
260 aa  64.7  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5807  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.04 
 
 
277 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.940742 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0013  putative integral membrane protein  28.39 
 
 
252 aa  52.4  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.287986  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0842  membrane-bound metal-dependent hydrolase  37.29 
 
 
163 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0932  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.63 
 
 
149 aa  42.4  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1532  membrane-bound metal-dependent hydrolase  47.37 
 
 
168 aa  42.4  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000376224  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0035  putative integral membrane protein  32.43 
 
 
236 aa  42.4  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.995493  normal  0.0275677 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>