26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5590 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5590  membrane-bound metal-dependent hydrolase  100 
 
 		 242 aa  458  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34910  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  60.83 
 
 		 254 aa  236  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.199547 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6479  membrane-bound metal-dependent hydrolase  39.37 
 
 		 268 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0013  putative integral membrane protein  40.94 
 
 		 252 aa  116  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.287986  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5807  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.78 
 
 		 277 aa  115  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.940742 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2977  membrane-bound metal-dependent hydrolase  38.02 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.48433  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3201  membrane-bound metal-dependent hydrolase  37.26 
 
 		 269 aa  113  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0757158 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2133  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.8 
 
 		 238 aa  99.8  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6744  hypothetical protein  34.8 
 
 		 242 aa  96.3  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019291  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3120  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.83 
 
 		 239 aa  88.6  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163778  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0630  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.73 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00076162  normal  0.281014 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2277  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.23 
 
 		 240 aa  85.5  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273545  normal  0.123352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8859  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.91 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2176  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.6 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0967  putative integral membrane protein  31.47 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416011  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1373  membrane-bound metal-dependent hydrolase  54.24 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275963 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1445  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.83 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0192  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.05 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.353069  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4226  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.28 
 
 		 285 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22930  putative membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.72 
 
 		 256 aa  50.4  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17380  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  33.86 
 
 		 272 aa  50.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.096354 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0035  putative integral membrane protein  33.64 
 
 		 236 aa  49.7  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.995493  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1246  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.72 
 
 		 274 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.482116  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1532  membrane-bound metal-dependent hydrolase  22.22 
 
 		 168 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000376224  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0842  membrane-bound metal-dependent hydrolase  42.19 
 
 		 163 aa  46.2  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1299  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.04 
 
 		 271 aa  43.5  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000344983 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>