22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5807 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5807  membrane-bound metal-dependent hydrolase  100 
 
 
277 aa  557  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.940742 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3201  membrane-bound metal-dependent hydrolase  52.32 
 
 
269 aa  258  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0757158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2977  membrane-bound metal-dependent hydrolase  51.9 
 
 
269 aa  256  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.48433  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6479  membrane-bound metal-dependent hydrolase  37.14 
 
 
268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5590  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.78 
 
 
242 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6744  hypothetical protein  34.62 
 
 
242 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019291  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34910  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  32.7 
 
 
254 aa  95.9  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.199547 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0630  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.98 
 
 
237 aa  95.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00076162  normal  0.281014 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0013  putative integral membrane protein  29.44 
 
 
252 aa  83.2  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.287986  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2133  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.29 
 
 
238 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2176  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.98 
 
 
235 aa  75.9  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0967  putative integral membrane protein  30.47 
 
 
237 aa  75.1  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416011  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0192  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.37 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.353069  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2277  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.39 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273545  normal  0.123352 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3120  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.42 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163778  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8859  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.75 
 
 
240 aa  55.5  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1445  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.08 
 
 
279 aa  55.5  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1373  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.9 
 
 
261 aa  48.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275963 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17380  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  41.27 
 
 
272 aa  46.2  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.096354 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22930  putative membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.36 
 
 
256 aa  46.2  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1299  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.85 
 
 
271 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000344983 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4226  membrane-bound metal-dependent hydrolase  25.31 
 
 
285 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>