58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2176 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2176  membrane-bound metal-dependent hydrolase  100 
 
 		 235 aa  463  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2133  membrane-bound metal-dependent hydrolase  76.17 
 
 		 238 aa  350  8.999999999999999e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3120  membrane-bound metal-dependent hydrolase  68.09 
 
 		 239 aa  295  4e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163778  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0630  membrane-bound metal-dependent hydrolase  40.18 
 
 		 237 aa  144  9e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00076162  normal  0.281014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6744  hypothetical protein  40.1 
 
 		 242 aa  142  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019291  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0967  putative integral membrane protein  40.62 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416011  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2277  membrane-bound metal-dependent hydrolase  40.26 
 
 		 240 aa  118  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273545  normal  0.123352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8859  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35 
 
 		 240 aa  111  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6479  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.85 
 
 		 268 aa  102  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5590  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.6 
 
 		 242 aa  89  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1445  membrane-bound metal-dependent hydrolase  39.43 
 
 		 279 aa  85.5  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5807  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.98 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.940742 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4226  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.47 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0192  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.77 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.353069  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3201  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.7 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0757158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2977  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.48 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.48433  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0013  putative integral membrane protein  36.04 
 
 		 252 aa  71.6  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.287986  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22930  putative membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.15 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17380  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  38.07 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.096354 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06660  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  37.68 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1299  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.31 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000344983 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4172  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.02 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1973  hypothetical protein  31.52 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01685  hypothetical protein  29.7 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.540311  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1914  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.52 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.109701  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1809  hypothetical protein  31.52 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1949  hypothetical protein  31.52 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2446  hypothetical protein  29.7 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01697  predicted inner membrane protein regulated by LexA  29.7 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1904  hypothetical protein  29.7 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.727123 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1463  hypothetical protein  29.7 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0212  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.43 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1435  hypothetical protein  29.76 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1450  hypothetical protein  29.76 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1418  hypothetical protein  29.76 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.597703  normal  0.0132689 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1850  hypothetical protein  29.76 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00111152  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2023  hypothetical protein  29.76 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1246  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.15 
 
 		 274 aa  55.1  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.482116  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1686  hypothetical protein  27.32 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0482652  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1796  hypothetical protein  27.32 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2650  hypothetical protein  27.32 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.141384  normal  0.0513814 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2446  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.8 
 
 		 156 aa  50.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1715  hypothetical protein  26.37 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.28693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1901  hypothetical protein  28 
 
 		 191 aa  49.7  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2194  hypothetical protein  27.43 
 
 		 191 aa  48.5  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0844  membrane-bound metal-dependent hydrolase  38.81 
 
 		 180 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0035  putative integral membrane protein  29.22 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.995493  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34910  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  44.12 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.199547 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2124  hypothetical protein  30.19 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000163059  hitchhiker  0.000408284 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1129  membrane-bound metal-dependent hydrolase  24.6 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4186  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.28 
 
 		 117 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.495485  normal  0.485593 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0842  membrane-bound metal-dependent hydrolase  46.55 
 
 		 163 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1771  hypothetical protein  22.16 
 
 		 169 aa  42.7  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2241  hypothetical protein  20.86 
 
 		 171 aa  42.7  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000136831  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2203  hypothetical protein  20.86 
 
 		 171 aa  42.7  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00120723  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0828  membrane-bound metal-dependent hydrolase  40.54 
 
 		 224 aa  41.6  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1554  membrane-bound metal-dependent hydrolase  40.54 
 
 		 224 aa  41.6  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1123  membrane-bound metal-dependent hydrolase  40.54 
 
 		 224 aa  41.6  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>