53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B1850 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A2023  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  407  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1850  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  407  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00111152  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1418  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  407  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.597703  normal  0.0132689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1450  hypothetical protein  99.5 
 
 
199 aa  407  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1435  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  407  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01697  predicted inner membrane protein regulated by LexA  86.67 
 
 
196 aa  361  3e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1904  hypothetical protein  86.67 
 
 
196 aa  361  3e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.727123 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01685  hypothetical protein  86.67 
 
 
196 aa  361  3e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.540311  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2446  hypothetical protein  86.67 
 
 
196 aa  361  3e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1463  hypothetical protein  86.67 
 
 
196 aa  361  3e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1715  hypothetical protein  86.15 
 
 
196 aa  360  6e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.28693  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1809  hypothetical protein  86.67 
 
 
196 aa  360  9e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1949  hypothetical protein  86.67 
 
 
196 aa  360  9e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1914  membrane-bound metal-dependent hydrolase  86.67 
 
 
196 aa  360  9e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.109701  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1973  hypothetical protein  86.15 
 
 
196 aa  358  3e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2194  hypothetical protein  60.21 
 
 
191 aa  244  8e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2124  hypothetical protein  70.19 
 
 
182 aa  243  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000163059  hitchhiker  0.000408284 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1901  hypothetical protein  68.48 
 
 
191 aa  241  5e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1963  hypothetical protein  65.68 
 
 
192 aa  233  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.175154  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1796  hypothetical protein  66.46 
 
 
182 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2650  hypothetical protein  66.46 
 
 
182 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.141384  normal  0.0513814 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1686  hypothetical protein  66.46 
 
 
182 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0482652  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1532  membrane-bound metal-dependent hydrolase  41.61 
 
 
168 aa  92.4  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000376224  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2241  hypothetical protein  33.33 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000136831  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2203  hypothetical protein  33.33 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00120723  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2634  membrane-bound metal-dependent hydrolase  41.74 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1203  putative metal-dependent hydrolase, membrane-bound  37.61 
 
 
196 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000395811  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0932  membrane-bound metal-dependent hydrolase  40.19 
 
 
149 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1028  putative metal-dependent hydrolase, membrane-bound  36.7 
 
 
196 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.508363  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1771  hypothetical protein  32.93 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4186  membrane-bound metal-dependent hydrolase  43.75 
 
 
117 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.495485  normal  0.485593 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0707  membrane-bound metal-dependent hydrolase  40.95 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0929969  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0842  membrane-bound metal-dependent hydrolase  38.73 
 
 
163 aa  69.7  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0323  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.97 
 
 
170 aa  68.2  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00272599  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1912  nuclease (SNase-like)  39.53 
 
 
323 aa  64.7  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183465  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0032  membrane-bound metal-dependent hydrolase  37.68 
 
 
368 aa  62  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  39.53 
 
 
324 aa  61.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2446  membrane-bound metal-dependent hydrolase  37.74 
 
 
156 aa  59.3  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2560  membrane-bound metal-dependent hydrolase  37.5 
 
 
187 aa  58.5  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00663072  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0109  hypothetical protein  33.58 
 
 
183 aa  57.8  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0075  hypothetical protein  32.85 
 
 
183 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2176  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.76 
 
 
235 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2133  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.31 
 
 
238 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3301  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.94 
 
 
130 aa  52  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3120  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.17 
 
 
239 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163778  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0310  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.25 
 
 
184 aa  48.5  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4627  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.73 
 
 
347 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2277  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.98 
 
 
240 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273545  normal  0.123352 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1445  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.19 
 
 
279 aa  45.1  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3018  membrane-bound metal-dependent hydrolase  45 
 
 
252 aa  43.9  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1169  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.91 
 
 
204 aa  42.4  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0844  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.65 
 
 
180 aa  42.4  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6744  hypothetical protein  25.77 
 
 
242 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019291  normal  0.228654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>