38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0844 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0844  membrane-bound metal-dependent hydrolase  100 
 
 
180 aa  362  2e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2203  hypothetical protein  30.77 
 
 
171 aa  61.2  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00120723  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2241  hypothetical protein  30.77 
 
 
171 aa  61.2  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000136831  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2446  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.61 
 
 
156 aa  58.9  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0707  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.52 
 
 
164 aa  58.2  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0929969  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1771  hypothetical protein  29.84 
 
 
169 aa  56.2  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5590  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.17 
 
 
242 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0075  hypothetical protein  34.58 
 
 
183 aa  45.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4186  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.54 
 
 
117 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.495485  normal  0.485593 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0109  hypothetical protein  33.83 
 
 
183 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4627  membrane-bound metal-dependent hydrolase  39.19 
 
 
347 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1904  hypothetical protein  28.57 
 
 
196 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.727123 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1463  hypothetical protein  28.57 
 
 
196 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01697  predicted inner membrane protein regulated by LexA  28.57 
 
 
196 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2446  hypothetical protein  28.57 
 
 
196 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01685  hypothetical protein  28.57 
 
 
196 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.540311  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0571  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.82 
 
 
196 aa  44.3  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.240779  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2094  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.84 
 
 
120 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2634  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.11 
 
 
167 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0032  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.34 
 
 
368 aa  43.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0323  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.68 
 
 
170 aa  42.7  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00272599  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1435  hypothetical protein  33.02 
 
 
199 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1450  hypothetical protein  33.02 
 
 
199 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1418  hypothetical protein  33.02 
 
 
199 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.597703  normal  0.0132689 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1850  hypothetical protein  33.02 
 
 
199 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00111152  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2023  hypothetical protein  33.02 
 
 
199 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1715  hypothetical protein  30.84 
 
 
196 aa  42.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.28693  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0842  membrane-bound metal-dependent hydrolase  39.02 
 
 
163 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3112  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.06 
 
 
196 aa  42.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1532  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.56 
 
 
168 aa  42.4  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000376224  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2133  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.91 
 
 
238 aa  42  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1028  putative metal-dependent hydrolase, membrane-bound  33.33 
 
 
196 aa  41.6  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.508363  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1973  hypothetical protein  27.82 
 
 
196 aa  41.6  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1949  hypothetical protein  27.82 
 
 
196 aa  41.2  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1809  hypothetical protein  27.82 
 
 
196 aa  41.2  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1914  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.82 
 
 
196 aa  41.2  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.109701  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1963  hypothetical protein  28.79 
 
 
192 aa  40.8  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.175154  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6744  hypothetical protein  36.51 
 
 
242 aa  40.8  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019291  normal  0.228654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>