57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1532 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1532  membrane-bound metal-dependent hydrolase  100 
 
 
168 aa  341  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000376224  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2634  membrane-bound metal-dependent hydrolase  65.85 
 
 
167 aa  229  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2023  hypothetical protein  41.61 
 
 
199 aa  92.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1850  hypothetical protein  41.61 
 
 
199 aa  92.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00111152  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1418  hypothetical protein  41.61 
 
 
199 aa  92.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.597703  normal  0.0132689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1450  hypothetical protein  41.61 
 
 
199 aa  92.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1435  hypothetical protein  41.61 
 
 
199 aa  92.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1715  hypothetical protein  39.71 
 
 
196 aa  89.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.28693  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01697  predicted inner membrane protein regulated by LexA  40.15 
 
 
196 aa  88.6  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1904  hypothetical protein  40.15 
 
 
196 aa  88.6  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.727123 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01685  hypothetical protein  40.15 
 
 
196 aa  88.6  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.540311  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2446  hypothetical protein  40.15 
 
 
196 aa  88.6  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1463  hypothetical protein  40.15 
 
 
196 aa  88.6  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1809  hypothetical protein  39.42 
 
 
196 aa  87.4  8e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1949  hypothetical protein  39.42 
 
 
196 aa  87.4  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1973  hypothetical protein  39.42 
 
 
196 aa  87.4  8e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0075  hypothetical protein  37.5 
 
 
183 aa  87.4  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1914  membrane-bound metal-dependent hydrolase  39.42 
 
 
196 aa  87.4  8e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.109701  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0109  hypothetical protein  37.69 
 
 
183 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2124  hypothetical protein  37.9 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000163059  hitchhiker  0.000408284 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2194  hypothetical protein  38.17 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1686  hypothetical protein  37.16 
 
 
182 aa  80.9  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0482652  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2650  hypothetical protein  37.16 
 
 
182 aa  80.9  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.141384  normal  0.0513814 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1796  hypothetical protein  37.16 
 
 
182 aa  80.9  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1901  hypothetical protein  37.4 
 
 
191 aa  80.5  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0842  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.67 
 
 
163 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1963  hypothetical protein  38.6 
 
 
192 aa  73.6  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.175154  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0932  membrane-bound metal-dependent hydrolase  40.17 
 
 
149 aa  72  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2241  hypothetical protein  32.33 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000136831  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2203  hypothetical protein  32.33 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00120723  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2446  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.29 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1028  putative metal-dependent hydrolase, membrane-bound  33.07 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.508363  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1203  putative metal-dependent hydrolase, membrane-bound  33.07 
 
 
196 aa  67.8  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000395811  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0707  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.29 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0929969  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4186  membrane-bound metal-dependent hydrolase  39.77 
 
 
117 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.495485  normal  0.485593 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1771  hypothetical protein  29.66 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0323  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.06 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00272599  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0310  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.32 
 
 
184 aa  63.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4627  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.86 
 
 
347 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1912  nuclease (SNase-like)  32 
 
 
323 aa  57  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183465  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0032  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.56 
 
 
368 aa  54.7  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  32.8 
 
 
324 aa  54.7  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0923  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.2 
 
 
187 aa  54.7  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010004  normal  0.0304863 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4895  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.1 
 
 
345 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3301  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.58 
 
 
130 aa  51.6  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2560  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.57 
 
 
187 aa  47.8  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00663072  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5590  membrane-bound metal-dependent hydrolase  22.22 
 
 
242 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08255  hypothetical protein  31.65 
 
 
172 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1381  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.46 
 
 
231 aa  45.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00159217  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0010  hypothetical protein  28.68 
 
 
172 aa  43.9  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2955  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.27 
 
 
323 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0714  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31 
 
 
248 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.169675  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1169  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.64 
 
 
204 aa  43.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8859  membrane-bound metal-dependent hydrolase  40.51 
 
 
240 aa  42  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3376  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.07 
 
 
182 aa  41.2  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3112  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.6 
 
 
196 aa  41.2  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4474  membrane-bound metal-dependent hydrolase  25.76 
 
 
153 aa  40.8  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>