23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3376 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3376  membrane-bound metal-dependent hydrolase  100 
 
 		 182 aa  352  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3699  hypothetical protein  98.35 
 
 		 182 aa  348  3e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3592  hypothetical protein  68.99 
 
 		 174 aa  190  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3883  hypothetical protein  65.19 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1851  hypothetical protein  69.43 
 
 		 174 aa  184  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.163042 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4415  hypothetical protein  67.72 
 
 		 174 aa  178  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4289  membrane-bound metal-dependent hydrolase  71.94 
 
 		 171 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.208948 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0618  hypothetical protein  72.14 
 
 		 172 aa  175  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0268751 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4594  hypothetical protein  64.1 
 
 		 174 aa  174  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238145  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4067  hypothetical protein  68.35 
 
 		 174 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0208636  normal  0.9668 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4180  hypothetical protein  64.94 
 
 		 174 aa  171  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.84562  normal  0.337483 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4186  hypothetical protein  64.94 
 
 		 174 aa  171  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.48428  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3337  hypothetical protein  64.94 
 
 		 174 aa  171  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1741  hypothetical protein  71.63 
 
 		 172 aa  168  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631778  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0372  hypothetical protein  70.92 
 
 		 172 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0329059  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0267  hypothetical protein  70.92 
 
 		 172 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1826  hypothetical protein  70.92 
 
 		 172 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.437082  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1329  hypothetical protein  70.92 
 
 		 172 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190348  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0300  hypothetical protein  70.92 
 
 		 172 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.861833  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0995  hypothetical protein  70.92 
 
 		 172 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0588221  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1133  hypothetical protein  69.5 
 
 		 172 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215518  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4474  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.3 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1532  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.07 
 
 		 168 aa  41.2  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000376224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>