52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1028 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1028  putative metal-dependent hydrolase, membrane-bound  100 
 
 		 196 aa  380  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.508363  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1203  putative metal-dependent hydrolase, membrane-bound  95.92 
 
 		 196 aa  370  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000395811  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2023  hypothetical protein  36.7 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1850  hypothetical protein  36.7 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00111152  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1418  hypothetical protein  36.7 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.597703  normal  0.0132689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1450  hypothetical protein  36.7 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1435  hypothetical protein  36.7 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1715  hypothetical protein  34.78 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.28693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2446  hypothetical protein  34.43 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01697  predicted inner membrane protein regulated by LexA  34.43 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1463  hypothetical protein  34.43 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1904  hypothetical protein  34.43 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.727123 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01685  hypothetical protein  34.43 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.540311  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1914  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.61 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.109701  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1949  hypothetical protein  33.61 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1809  hypothetical protein  33.61 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1973  hypothetical protein  33.61 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1532  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.07 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000376224  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1963  hypothetical protein  30.43 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.175154  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0932  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.44 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2194  hypothetical protein  33.93 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1901  hypothetical protein  33.04 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1686  hypothetical protein  30.83 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0482652  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1796  hypothetical protein  30.83 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2650  hypothetical protein  30.83 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.141384  normal  0.0513814 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2241  hypothetical protein  32.03 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000136831  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2203  hypothetical protein  32.03 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00120723  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2124  hypothetical protein  31.93 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000163059  hitchhiker  0.000408284 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2634  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.79 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3301  membrane-bound metal-dependent hydrolase  38.16 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0842  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.36 
 
 		 163 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1169  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.23 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0310  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.45 
 
 		 184 aa  52  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0323  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.07 
 
 		 170 aa  52  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00272599  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1771  hypothetical protein  30.99 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4186  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.96 
 
 		 117 aa  48.5  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.495485  normal  0.485593 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0707  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.48 
 
 		 164 aa  48.1  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0929969  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0075  hypothetical protein  28.97 
 
 		 183 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2200  membrane-bound metal-dependent hydrolase  43.75 
 
 		 154 aa  47  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0109  hypothetical protein  29.67 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3018  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.79 
 
 		 252 aa  45.8  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4895  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.28 
 
 		 345 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2446  membrane-bound metal-dependent hydrolase  39.33 
 
 		 156 aa  44.3  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4627  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.62 
 
 		 347 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0032  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.93 
 
 		 368 aa  44.3  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1380  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.41 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3150  hypothetical protein  29.41 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.552218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1266  putative metal-dependent hydrolase, membrane-bound  29.41 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0923  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010004  normal  0.0304863 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2560  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.95 
 
 		 187 aa  42.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00663072  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01789  hypothetical protein  31.65 
 
 		 314 aa  42  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0844  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.33 
 
 		 180 aa  41.2  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>