26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2200 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2200  membrane-bound metal-dependent hydrolase  100 
 
 
154 aa  290  6e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1028  putative metal-dependent hydrolase, membrane-bound  28.3 
 
 
196 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.508363  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1203  putative metal-dependent hydrolase, membrane-bound  28.93 
 
 
196 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000395811  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2446  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.38 
 
 
156 aa  47.8  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0323  membrane-bound metal-dependent hydrolase  62.79 
 
 
170 aa  47.4  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00272599  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2124  hypothetical protein  40.91 
 
 
182 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000163059  hitchhiker  0.000408284 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3301  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.43 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1532  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.03 
 
 
168 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000376224  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0932  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.54 
 
 
149 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2194  hypothetical protein  38.1 
 
 
191 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0707  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.79 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0929969  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1901  hypothetical protein  39.29 
 
 
191 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01685  hypothetical protein  40.23 
 
 
196 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.540311  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01697  predicted inner membrane protein regulated by LexA  40.23 
 
 
196 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1904  hypothetical protein  40.23 
 
 
196 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.727123 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1463  hypothetical protein  40.23 
 
 
196 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1771  hypothetical protein  30 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2446  hypothetical protein  40.23 
 
 
196 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1914  membrane-bound metal-dependent hydrolase  40.23 
 
 
196 aa  41.6  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.109701  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1973  hypothetical protein  40.23 
 
 
196 aa  41.6  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1949  hypothetical protein  40.23 
 
 
196 aa  41.6  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1809  hypothetical protein  40.23 
 
 
196 aa  41.6  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1796  hypothetical protein  38.89 
 
 
182 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2650  hypothetical protein  38.89 
 
 
182 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.141384  normal  0.0513814 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1686  hypothetical protein  38.89 
 
 
182 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0482652  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1715  hypothetical protein  36.78 
 
 
196 aa  41.2  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.28693  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>