54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2124 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2124  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  370  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000163059  hitchhiker  0.000408284 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1796  hypothetical protein  73.08 
 
 		 182 aa  286  9e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2650  hypothetical protein  73.08 
 
 		 182 aa  286  9e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.141384  normal  0.0513814 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1686  hypothetical protein  73.08 
 
 		 182 aa  286  9e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0482652  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2194  hypothetical protein  76.4 
 
 		 191 aa  266  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1901  hypothetical protein  75.16 
 
 		 191 aa  261  3e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1963  hypothetical protein  73.29 
 
 		 192 aa  251  4.0000000000000004e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.175154  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01685  hypothetical protein  70.81 
 
 		 196 aa  248  4e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.540311  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2446  hypothetical protein  70.81 
 
 		 196 aa  248  4e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1463  hypothetical protein  70.81 
 
 		 196 aa  248  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1904  hypothetical protein  70.81 
 
 		 196 aa  248  4e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.727123 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01697  predicted inner membrane protein regulated by LexA  70.81 
 
 		 196 aa  248  4e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1715  hypothetical protein  69.57 
 
 		 196 aa  247  6e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.28693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1973  hypothetical protein  70.19 
 
 		 196 aa  246  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1914  membrane-bound metal-dependent hydrolase  70.19 
 
 		 196 aa  246  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.109701  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1949  hypothetical protein  70.19 
 
 		 196 aa  246  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1809  hypothetical protein  70.19 
 
 		 196 aa  246  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1418  hypothetical protein  70.19 
 
 		 199 aa  243  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.597703  normal  0.0132689 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1435  hypothetical protein  70.19 
 
 		 199 aa  243  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1850  hypothetical protein  70.19 
 
 		 199 aa  243  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00111152  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2023  hypothetical protein  70.19 
 
 		 199 aa  243  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1450  hypothetical protein  70.19 
 
 		 199 aa  243  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1532  membrane-bound metal-dependent hydrolase  37.9 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000376224  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1771  hypothetical protein  36.43 
 
 		 169 aa  80.5  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2241  hypothetical protein  36.72 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000136831  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2203  hypothetical protein  36.72 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00120723  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0932  membrane-bound metal-dependent hydrolase  37.4 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2634  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.8 
 
 		 167 aa  73.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4186  membrane-bound metal-dependent hydrolase  44.79 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.495485  normal  0.485593 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0032  membrane-bound metal-dependent hydrolase  39.5 
 
 		 368 aa  69.3  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0323  membrane-bound metal-dependent hydrolase  39.32 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00272599  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0707  membrane-bound metal-dependent hydrolase  39.05 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0929969  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  38.24 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1912  nuclease (SNase-like)  37.5 
 
 		 323 aa  61.6  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183465  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0842  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.38 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1028  putative metal-dependent hydrolase, membrane-bound  31.93 
 
 		 196 aa  60.8  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.508363  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1203  putative metal-dependent hydrolase, membrane-bound  33.04 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000395811  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2560  membrane-bound metal-dependent hydrolase  42.86 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00663072  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0075  hypothetical protein  29.61 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0109  hypothetical protein  32.35 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2446  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.84 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0310  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.42 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4627  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.81 
 
 		 347 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3301  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.7 
 
 		 130 aa  50.1  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2277  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.54 
 
 		 240 aa  47  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273545  normal  0.123352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6744  hypothetical protein  24.39 
 
 		 242 aa  44.7  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019291  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2133  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.17 
 
 		 238 aa  44.7  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0923  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.71 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010004  normal  0.0304863 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2176  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.76 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3120  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.85 
 
 		 239 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163778  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0192  membrane-bound metal-dependent hydrolase  25.63 
 
 		 291 aa  43.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.353069  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0040  hypothetical protein  35.14 
 
 		 331 aa  41.6  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2955  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.17 
 
 		 323 aa  41.2  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0041  hypothetical protein  35.19 
 
 		 331 aa  41.2  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>