46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6744 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6744  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  481  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019291  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2277  membrane-bound metal-dependent hydrolase  60.91 
 
 		 240 aa  261  8e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273545  normal  0.123352 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0630  membrane-bound metal-dependent hydrolase  40.51 
 
 		 237 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00076162  normal  0.281014 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0967  putative integral membrane protein  40.52 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416011  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3120  membrane-bound metal-dependent hydrolase  41.63 
 
 		 239 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163778  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2133  membrane-bound metal-dependent hydrolase  38.86 
 
 		 238 aa  136  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2176  membrane-bound metal-dependent hydrolase  37 
 
 		 235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8859  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.82 
 
 		 240 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6479  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.96 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1445  membrane-bound metal-dependent hydrolase  41.46 
 
 		 279 aa  108  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5807  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.3 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.940742 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5590  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.24 
 
 		 242 aa  97.1  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4226  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.36 
 
 		 285 aa  94  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0192  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.02 
 
 		 291 aa  89  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.353069  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3201  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.04 
 
 		 269 aa  87.8  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0757158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2977  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.28 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.48433  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4172  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.95 
 
 		 237 aa  85.1  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1299  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.36 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000344983 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22930  putative membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.93 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17380  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  34.39 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.096354 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34910  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  31.7 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.199547 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0035  putative integral membrane protein  32.82 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.995493  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06660  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  34.4 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0212  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.6 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1246  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.85 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.482116  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0013  putative integral membrane protein  29.57 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.287986  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2446  membrane-bound metal-dependent hydrolase  43.75 
 
 		 156 aa  49.3  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0842  membrane-bound metal-dependent hydrolase  40.85 
 
 		 163 aa  49.7  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2194  hypothetical protein  27.75 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1129  membrane-bound metal-dependent hydrolase  25.57 
 
 		 224 aa  46.2  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1901  hypothetical protein  27.75 
 
 		 191 aa  46.6  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2124  hypothetical protein  24.39 
 
 		 182 aa  44.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000163059  hitchhiker  0.000408284 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2446  hypothetical protein  27.03 
 
 		 196 aa  43.5  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01685  hypothetical protein  27.03 
 
 		 196 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.540311  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01697  predicted inner membrane protein regulated by LexA  27.03 
 
 		 196 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1463  hypothetical protein  27.03 
 
 		 196 aa  43.5  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1904  hypothetical protein  27.03 
 
 		 196 aa  43.5  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.727123 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1973  hypothetical protein  27.03 
 
 		 196 aa  42.7  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1949  hypothetical protein  27.03 
 
 		 196 aa  42.4  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1809  hypothetical protein  27.03 
 
 		 196 aa  42.4  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1914  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.03 
 
 		 196 aa  42.4  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.109701  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2023  hypothetical protein  28.83 
 
 		 199 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1850  hypothetical protein  28.83 
 
 		 199 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00111152  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1418  hypothetical protein  28.83 
 
 		 199 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.597703  normal  0.0132689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1450  hypothetical protein  28.83 
 
 		 199 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1435  hypothetical protein  28.83 
 
 		 199 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>