45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1445 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1445  membrane-bound metal-dependent hydrolase  100 
 
 
279 aa  538  9.999999999999999e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0192  membrane-bound metal-dependent hydrolase  55.68 
 
 
291 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.353069  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4226  membrane-bound metal-dependent hydrolase  45.71 
 
 
285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1299  membrane-bound metal-dependent hydrolase  48.25 
 
 
271 aa  210  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000344983 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1246  membrane-bound metal-dependent hydrolase  46.38 
 
 
274 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.482116  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0212  membrane-bound metal-dependent hydrolase  48.71 
 
 
266 aa  185  6e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17380  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  48.98 
 
 
272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.096354 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22930  putative membrane-bound metal-dependent hydrolase  45.75 
 
 
256 aa  150  3e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06660  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  42.56 
 
 
260 aa  137  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6744  hypothetical protein  38.68 
 
 
242 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019291  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8859  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.97 
 
 
240 aa  102  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0630  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.98 
 
 
237 aa  94.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00076162  normal  0.281014 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2277  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.59 
 
 
240 aa  93.2  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273545  normal  0.123352 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0967  putative integral membrane protein  32.86 
 
 
237 aa  88.6  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416011  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2133  membrane-bound metal-dependent hydrolase  38.24 
 
 
238 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3120  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.77 
 
 
239 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163778  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2176  membrane-bound metal-dependent hydrolase  38.5 
 
 
235 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3201  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.28 
 
 
269 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0757158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6479  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.02 
 
 
268 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2977  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.11 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.48433  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5807  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.61 
 
 
277 aa  69.3  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.940742 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5590  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.2 
 
 
242 aa  60.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4172  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.48 
 
 
237 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0035  putative integral membrane protein  30.3 
 
 
236 aa  50.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.995493  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0013  putative integral membrane protein  30.37 
 
 
252 aa  50.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.287986  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34910  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  31.65 
 
 
254 aa  49.3  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.199547 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2446  hypothetical protein  30.3 
 
 
196 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01685  hypothetical protein  30.3 
 
 
196 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.540311  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01697  predicted inner membrane protein regulated by LexA  30.3 
 
 
196 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1904  hypothetical protein  30.3 
 
 
196 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.727123 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1463  hypothetical protein  30.3 
 
 
196 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1715  hypothetical protein  29.27 
 
 
196 aa  47.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.28693  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2194  hypothetical protein  29.07 
 
 
191 aa  47  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1914  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.3 
 
 
196 aa  47  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.109701  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1809  hypothetical protein  30.3 
 
 
196 aa  47  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1949  hypothetical protein  30.3 
 
 
196 aa  47  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1973  hypothetical protein  30.3 
 
 
196 aa  47  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1373  membrane-bound metal-dependent hydrolase  68.75 
 
 
261 aa  46.2  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275963 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1435  hypothetical protein  28.19 
 
 
199 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1450  hypothetical protein  28.19 
 
 
199 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1418  hypothetical protein  28.19 
 
 
199 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.597703  normal  0.0132689 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1850  hypothetical protein  28.19 
 
 
199 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00111152  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2023  hypothetical protein  28.19 
 
 
199 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1901  hypothetical protein  29.07 
 
 
191 aa  44.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1963  hypothetical protein  27.27 
 
 
192 aa  42.7  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.175154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>