26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_17380 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_17380  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  100 
 
 		 272 aa  500  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.096354 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0192  membrane-bound metal-dependent hydrolase  49.19 
 
 		 291 aa  191  8e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.353069  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1299  membrane-bound metal-dependent hydrolase  46.4 
 
 		 271 aa  190  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000344983 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1445  membrane-bound metal-dependent hydrolase  46.72 
 
 		 279 aa  177  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1246  membrane-bound metal-dependent hydrolase  42.06 
 
 		 274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.482116  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4226  membrane-bound metal-dependent hydrolase  38.84 
 
 		 285 aa  163  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0212  membrane-bound metal-dependent hydrolase  44.12 
 
 		 266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06660  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  44.67 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22930  putative membrane-bound metal-dependent hydrolase  42.11 
 
 		 256 aa  112  9e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6744  hypothetical protein  34.39 
 
 		 242 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019291  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0630  membrane-bound metal-dependent hydrolase  37 
 
 		 237 aa  96.7  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00076162  normal  0.281014 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8859  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.99 
 
 		 240 aa  85.9  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0967  putative integral membrane protein  33.33 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416011  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2133  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.32 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6479  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.97 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3201  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.81 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0757158 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2176  membrane-bound metal-dependent hydrolase  38.07 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3120  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.09 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163778  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2977  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.85 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.48433  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0013  putative integral membrane protein  34.42 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.287986  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5590  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.06 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2277  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.27 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273545  normal  0.123352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5807  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.48 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.940742 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34910  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  32.44 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.199547 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4172  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.83 
 
 		 237 aa  53.9  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1129  membrane-bound metal-dependent hydrolase  25.68 
 
 		 224 aa  48.9  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>