24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0212 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0212  membrane-bound metal-dependent hydrolase  100 
 
 
266 aa  514  1.0000000000000001e-145  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0192  membrane-bound metal-dependent hydrolase  45.61 
 
 
291 aa  205  5e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.353069  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1445  membrane-bound metal-dependent hydrolase  45.29 
 
 
279 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1299  membrane-bound metal-dependent hydrolase  46.54 
 
 
271 aa  179  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000344983 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1246  membrane-bound metal-dependent hydrolase  43.84 
 
 
274 aa  178  7e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.482116  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4226  membrane-bound metal-dependent hydrolase  44.16 
 
 
285 aa  166  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17380  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  43.32 
 
 
272 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.096354 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22930  putative membrane-bound metal-dependent hydrolase  41.53 
 
 
256 aa  125  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06660  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  38.33 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6744  hypothetical protein  35.85 
 
 
242 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019291  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0630  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.84 
 
 
237 aa  87.8  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00076162  normal  0.281014 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8859  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.17 
 
 
240 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2133  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.18 
 
 
238 aa  75.9  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3120  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35 
 
 
239 aa  72  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163778  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0967  putative integral membrane protein  32.66 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416011  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2277  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.9 
 
 
240 aa  68.9  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273545  normal  0.123352 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6479  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.17 
 
 
268 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2176  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.33 
 
 
235 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3201  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.84 
 
 
269 aa  57  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0757158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2977  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.07 
 
 
269 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.48433  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5807  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.24 
 
 
277 aa  52.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.940742 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0013  putative integral membrane protein  29.28 
 
 
252 aa  50.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.287986  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4172  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.57 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5590  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.34 
 
 
242 aa  42.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>