28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0192 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0192  membrane-bound metal-dependent hydrolase  100 
 
 
291 aa  551  1e-156  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.353069  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1445  membrane-bound metal-dependent hydrolase  54.86 
 
 
279 aa  258  1e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4226  membrane-bound metal-dependent hydrolase  47.64 
 
 
285 aa  224  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1246  membrane-bound metal-dependent hydrolase  46.55 
 
 
274 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.482116  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1299  membrane-bound metal-dependent hydrolase  45.41 
 
 
271 aa  189  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000344983 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0212  membrane-bound metal-dependent hydrolase  46.09 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17380  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  48.56 
 
 
272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.096354 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22930  putative membrane-bound metal-dependent hydrolase  46.6 
 
 
256 aa  145  5e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06660  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  38.17 
 
 
260 aa  106  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0630  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.32 
 
 
237 aa  99.8  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00076162  normal  0.281014 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8859  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.6 
 
 
240 aa  94.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6744  hypothetical protein  33.02 
 
 
242 aa  89  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019291  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3201  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.98 
 
 
269 aa  82.4  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0757158 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0967  putative integral membrane protein  33.99 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416011  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2977  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.74 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.48433  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2277  membrane-bound metal-dependent hydrolase  37.65 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273545  normal  0.123352 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2133  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.85 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5807  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.37 
 
 
277 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.940742 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3120  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.46 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163778  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2176  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.16 
 
 
235 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6479  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.04 
 
 
268 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5590  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.05 
 
 
242 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0013  putative integral membrane protein  31.41 
 
 
252 aa  50.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.287986  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4172  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.9 
 
 
237 aa  46.6  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2194  hypothetical protein  27.75 
 
 
191 aa  46.2  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2124  hypothetical protein  25.74 
 
 
182 aa  44.3  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000163059  hitchhiker  0.000408284 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1901  hypothetical protein  27.75 
 
 
191 aa  43.1  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34910  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  29.34 
 
 
254 aa  42.4  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.199547 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>