29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6479 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6479  membrane-bound metal-dependent hydrolase  100 
 
 		 268 aa  537  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5807  membrane-bound metal-dependent hydrolase  37.14 
 
 		 277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.940742 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5590  membrane-bound metal-dependent hydrolase  39.92 
 
 		 242 aa  153  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3201  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.82 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0757158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2977  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.74 
 
 		 269 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.48433  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34910  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  37.41 
 
 		 254 aa  131  9e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.199547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6744  hypothetical protein  34.27 
 
 		 242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019291  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0630  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.6 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00076162  normal  0.281014 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2277  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.76 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273545  normal  0.123352 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0013  putative integral membrane protein  35.65 
 
 		 252 aa  103  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.287986  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2133  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.89 
 
 		 238 aa  93.2  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2176  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.85 
 
 		 235 aa  92.8  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0967  putative integral membrane protein  28.51 
 
 		 237 aa  92.8  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416011  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3120  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.73 
 
 		 239 aa  90.9  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163778  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8859  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.09 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1445  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.57 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1373  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.67 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275963 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4226  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.61 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1299  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.44 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000344983 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0192  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.04 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.353069  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0212  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.96 
 
 		 266 aa  53.5  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17380  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  45.59 
 
 		 272 aa  52  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.096354 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1246  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.22 
 
 		 274 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.482116  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22930  putative membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.51 
 
 		 256 aa  49.7  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06660  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  33.33 
 
 		 260 aa  49.3  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0842  membrane-bound metal-dependent hydrolase  39.71 
 
 		 163 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4172  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30 
 
 		 237 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2203  hypothetical protein  27.42 
 
 		 171 aa  43.5  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00120723  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2241  hypothetical protein  27.42 
 
 		 171 aa  43.5  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000136831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>