26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_34910 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_34910  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  100 
 
 		 254 aa  498  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.199547 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5590  membrane-bound metal-dependent hydrolase  60.83 
 
 		 242 aa  259  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6479  membrane-bound metal-dependent hydrolase  37.88 
 
 		 268 aa  142  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5807  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.08 
 
 		 277 aa  115  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.940742 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3201  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.32 
 
 		 269 aa  115  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0757158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2977  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.42 
 
 		 269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.48433  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0013  putative integral membrane protein  38.86 
 
 		 252 aa  94.7  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.287986  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2133  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.83 
 
 		 238 aa  91.7  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6744  hypothetical protein  32.79 
 
 		 242 aa  86.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019291  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8859  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.59 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3120  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.24 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163778  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2176  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.33 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2277  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.64 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273545  normal  0.123352 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0630  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.89 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00076162  normal  0.281014 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0967  putative integral membrane protein  27.48 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416011  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06660  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  34.57 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1445  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.14 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0192  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.09 
 
 		 291 aa  53.5  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.353069  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1373  membrane-bound metal-dependent hydrolase  43.55 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275963 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22930  putative membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.66 
 
 		 256 aa  50.4  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0035  putative integral membrane protein  29.79 
 
 		 236 aa  50.4  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.995493  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1299  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.29 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000344983 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4226  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.77 
 
 		 285 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0842  membrane-bound metal-dependent hydrolase  38.82 
 
 		 163 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1246  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.5 
 
 		 274 aa  46.2  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.482116  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4172  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.67 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>