54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1914 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1914  membrane-bound metal-dependent hydrolase  100 
 
 		 196 aa  401  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.109701  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1949  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  401  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1809  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  401  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1973  hypothetical protein  99.49 
 
 		 196 aa  399  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1463  hypothetical protein  99.49 
 
 		 196 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1904  hypothetical protein  99.49 
 
 		 196 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.727123 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01697  predicted inner membrane protein regulated by LexA  99.49 
 
 		 196 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01685  hypothetical protein  99.49 
 
 		 196 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.540311  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2446  hypothetical protein  99.49 
 
 		 196 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1715  hypothetical protein  86.73 
 
 		 196 aa  362  3e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.28693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1435  hypothetical protein  86.67 
 
 		 199 aa  360  8e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1418  hypothetical protein  86.67 
 
 		 199 aa  360  8e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.597703  normal  0.0132689 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1850  hypothetical protein  86.67 
 
 		 199 aa  360  8e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00111152  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2023  hypothetical protein  86.67 
 
 		 199 aa  360  8e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1450  hypothetical protein  86.15 
 
 		 199 aa  359  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2194  hypothetical protein  61.26 
 
 		 191 aa  248  5e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2124  hypothetical protein  70.19 
 
 		 182 aa  246  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000163059  hitchhiker  0.000408284 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1901  hypothetical protein  61.26 
 
 		 191 aa  245  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1686  hypothetical protein  66.46 
 
 		 182 aa  233  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0482652  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2650  hypothetical protein  66.46 
 
 		 182 aa  233  1.0000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.141384  normal  0.0513814 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1796  hypothetical protein  66.46 
 
 		 182 aa  233  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1963  hypothetical protein  58.42 
 
 		 192 aa  231  4.0000000000000004e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.175154  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1532  membrane-bound metal-dependent hydrolase  39.42 
 
 		 168 aa  87.4  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000376224  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2203  hypothetical protein  32.12 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00120723  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2241  hypothetical protein  32.12 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000136831  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2634  membrane-bound metal-dependent hydrolase  39.45 
 
 		 167 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0932  membrane-bound metal-dependent hydrolase  42.59 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4186  membrane-bound metal-dependent hydrolase  44.55 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.495485  normal  0.485593 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1028  putative metal-dependent hydrolase, membrane-bound  33.61 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.508363  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0707  membrane-bound metal-dependent hydrolase  41.28 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0929969  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1203  putative metal-dependent hydrolase, membrane-bound  35.29 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000395811  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1771  hypothetical protein  30.23 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0323  membrane-bound metal-dependent hydrolase  38.41 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00272599  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0842  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.43 
 
 		 163 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1912  nuclease (SNase-like)  36.76 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183465  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  36.76 
 
 		 324 aa  61.6  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0032  membrane-bound metal-dependent hydrolase  42.86 
 
 		 368 aa  61.2  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2560  membrane-bound metal-dependent hydrolase  39.29 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00663072  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2446  membrane-bound metal-dependent hydrolase  41.24 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2176  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.33 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0109  hypothetical protein  31.39 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0075  hypothetical protein  30.66 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2133  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.88 
 
 		 238 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3120  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.57 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163778  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3301  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.94 
 
 		 130 aa  52.8  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0310  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.25 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4627  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.64 
 
 		 347 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1169  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.01 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1445  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.91 
 
 		 279 aa  47  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2277  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.71 
 
 		 240 aa  45.1  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273545  normal  0.123352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6744  hypothetical protein  27.03 
 
 		 242 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019291  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3018  membrane-bound metal-dependent hydrolase  45 
 
 		 252 aa  42  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4895  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.68 
 
 		 345 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0844  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.57 
 
 		 180 aa  41.2  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>