55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1771 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1771  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  336  8e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2241  hypothetical protein  71.01 
 
 		 171 aa  259  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000136831  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2203  hypothetical protein  71.01 
 
 		 171 aa  259  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00120723  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2124  hypothetical protein  36.43 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000163059  hitchhiker  0.000408284 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2194  hypothetical protein  35.97 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1796  hypothetical protein  33.8 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1901  hypothetical protein  35.25 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2650  hypothetical protein  33.8 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.141384  normal  0.0513814 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1686  hypothetical protein  33.8 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0482652  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1435  hypothetical protein  32.93 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1418  hypothetical protein  32.93 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.597703  normal  0.0132689 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1850  hypothetical protein  32.93 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00111152  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2023  hypothetical protein  32.93 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2446  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.94 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1450  hypothetical protein  32.93 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1715  hypothetical protein  35.16 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.28693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2446  hypothetical protein  30.23 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1904  hypothetical protein  30.23 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.727123 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01697  predicted inner membrane protein regulated by LexA  30.23 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01685  hypothetical protein  30.23 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.540311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1463  hypothetical protein  30.23 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1809  hypothetical protein  30.23 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1949  hypothetical protein  30.23 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1973  hypothetical protein  30.23 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1914  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.23 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.109701  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1963  hypothetical protein  36.03 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.175154  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0932  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.16 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1532  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.66 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000376224  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4186  membrane-bound metal-dependent hydrolase  41.38 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.495485  normal  0.485593 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0032  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.76 
 
 		 368 aa  61.6  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3301  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.22 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2634  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.03 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0707  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.87 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0929969  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0075  hypothetical protein  36.36 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0109  hypothetical protein  36.36 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4627  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.08 
 
 		 347 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1169  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.36 
 
 		 204 aa  52.4  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1203  putative metal-dependent hydrolase, membrane-bound  32.39 
 
 		 196 aa  52  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000395811  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3120  membrane-bound metal-dependent hydrolase  23.29 
 
 		 239 aa  50.8  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163778  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1028  putative metal-dependent hydrolase, membrane-bound  30.99 
 
 		 196 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.508363  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0842  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.36 
 
 		 163 aa  48.5  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0323  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.29 
 
 		 170 aa  47.8  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00272599  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1912  nuclease (SNase-like)  31.91 
 
 		 323 aa  47.8  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183465  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4895  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.95 
 
 		 345 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2560  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.14 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00663072  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  31.91 
 
 		 324 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0844  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.84 
 
 		 180 aa  45.1  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0923  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.32 
 
 		 187 aa  44.7  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010004  normal  0.0304863 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0310  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.08 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2133  membrane-bound metal-dependent hydrolase  20.39 
 
 		 238 aa  42.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3586  hypothetical protein  35.71 
 
 		 351 aa  42  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.13402  normal  0.0430121 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0571  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.62 
 
 		 196 aa  42  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.240779  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0633  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.77 
 
 		 351 aa  42  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.153204 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3112  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.62 
 
 		 196 aa  41.6  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3590  hypothetical protein  35.09 
 
 		 350 aa  40.8  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.137562  normal  0.0657655 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>