44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_A0032 on replicon NC_007483
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007483  Noc_A0032  membrane-bound metal-dependent hydrolase  100 
 
 
368 aa  744    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  35.5 
 
 
324 aa  94.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1912  nuclease (SNase-like)  35 
 
 
323 aa  94  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183465  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4627  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.15 
 
 
347 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1686  hypothetical protein  39.26 
 
 
182 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0482652  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1796  hypothetical protein  39.26 
 
 
182 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2650  hypothetical protein  39.26 
 
 
182 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.141384  normal  0.0513814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4895  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.09 
 
 
345 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2124  hypothetical protein  39.5 
 
 
182 aa  69.3  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000163059  hitchhiker  0.000408284 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2194  hypothetical protein  41.51 
 
 
191 aa  67.8  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0932  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.94 
 
 
149 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2241  hypothetical protein  36.84 
 
 
171 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000136831  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2203  hypothetical protein  36.84 
 
 
171 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00120723  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1963  hypothetical protein  38.19 
 
 
192 aa  65.5  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.175154  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1901  hypothetical protein  38.41 
 
 
191 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1715  hypothetical protein  38.71 
 
 
196 aa  65.1  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.28693  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1904  hypothetical protein  42.86 
 
 
196 aa  62  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.727123 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1435  hypothetical protein  37.68 
 
 
199 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1463  hypothetical protein  42.86 
 
 
196 aa  62  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1418  hypothetical protein  37.68 
 
 
199 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.597703  normal  0.0132689 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1850  hypothetical protein  37.68 
 
 
199 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00111152  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2023  hypothetical protein  37.68 
 
 
199 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2446  hypothetical protein  42.86 
 
 
196 aa  62  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01685  hypothetical protein  42.86 
 
 
196 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.540311  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01697  predicted inner membrane protein regulated by LexA  42.86 
 
 
196 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1450  hypothetical protein  37.68 
 
 
199 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1914  membrane-bound metal-dependent hydrolase  42.86 
 
 
196 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.109701  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1771  hypothetical protein  36.76 
 
 
169 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1949  hypothetical protein  42.86 
 
 
196 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1809  hypothetical protein  42.86 
 
 
196 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0075  hypothetical protein  31.17 
 
 
183 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1973  hypothetical protein  42.86 
 
 
196 aa  61.6  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0109  hypothetical protein  32 
 
 
183 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0707  membrane-bound metal-dependent hydrolase  47.78 
 
 
164 aa  58.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0929969  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2634  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.61 
 
 
167 aa  56.6  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2560  membrane-bound metal-dependent hydrolase  38.26 
 
 
187 aa  56.6  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00663072  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1532  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.74 
 
 
168 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000376224  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2446  membrane-bound metal-dependent hydrolase  40 
 
 
156 aa  49.7  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4186  membrane-bound metal-dependent hydrolase  39.33 
 
 
117 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.495485  normal  0.485593 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0842  membrane-bound metal-dependent hydrolase  38.68 
 
 
163 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1203  putative metal-dependent hydrolase, membrane-bound  28.1 
 
 
196 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000395811  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1028  putative metal-dependent hydrolase, membrane-bound  28.93 
 
 
196 aa  43.9  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.508363  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0323  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.17 
 
 
170 aa  42.7  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00272599  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2955  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.81 
 
 
323 aa  42.7  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>