17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0923 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0923  membrane-bound metal-dependent hydrolase  100 
 
 
187 aa  380  1e-105  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010004  normal  0.0304863 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0109  hypothetical protein  34.48 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0075  hypothetical protein  34.1 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2634  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.37 
 
 
167 aa  63.2  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1532  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.2 
 
 
168 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000376224  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2955  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.86 
 
 
323 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1771  hypothetical protein  27.67 
 
 
169 aa  46.6  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2241  hypothetical protein  25 
 
 
171 aa  45.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000136831  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2203  hypothetical protein  25 
 
 
171 aa  45.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00120723  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0932  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.78 
 
 
149 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4186  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.86 
 
 
117 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.495485  normal  0.485593 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2124  hypothetical protein  26.71 
 
 
182 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000163059  hitchhiker  0.000408284 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1028  putative metal-dependent hydrolase, membrane-bound  32 
 
 
196 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.508363  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1203  putative metal-dependent hydrolase, membrane-bound  30 
 
 
196 aa  42.4  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000395811  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1901  hypothetical protein  25.95 
 
 
191 aa  42.4  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2194  hypothetical protein  25.87 
 
 
191 aa  42.4  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0310  membrane-bound metal-dependent hydrolase  24.22 
 
 
184 aa  41.6  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>