33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1380 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1380  membrane-bound metal-dependent hydrolase  100 
 
 		 182 aa  355  2.9999999999999997e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3150  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  355  2.9999999999999997e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.552218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1266  putative metal-dependent hydrolase, membrane-bound  100 
 
 		 182 aa  355  2.9999999999999997e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0588  inner membrane protein YbcI  73.26 
 
 		 181 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.337402 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0648  hypothetical protein  73.26 
 
 		 181 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0593  inner membrane protein YbcI  73.26 
 
 		 181 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417884  normal  0.0138038 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3086  membrane-bound metal-dependent hydrolase  71.68 
 
 		 173 aa  232  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000669215  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0447  hypothetical protein  71.68 
 
 		 173 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000487062  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0567  hypothetical protein  71.68 
 
 		 173 aa  232  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000105687  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0602  hypothetical protein  71.68 
 
 		 173 aa  232  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000045607  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0586  inner membrane protein YbcI  72.67 
 
 		 181 aa  231  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.150683  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3095  membrane-bound metal-dependent hydrolase  71.68 
 
 		 173 aa  231  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0342727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0585  inner membrane protein YbcI  72.09 
 
 		 181 aa  231  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0279815 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00482  hypothetical protein  70.52 
 
 		 173 aa  228  3e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.275959  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0628  hypothetical protein  71.1 
 
 		 173 aa  228  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0247504  normal  0.919705 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00477  conserved inner membrane protein  70.52 
 
 		 173 aa  228  3e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.185455  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0572  hypothetical protein  71.68 
 
 		 173 aa  228  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0154428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0588  membrane-bound metal-dependent hydrolase  48.57 
 
 		 193 aa  149  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.455878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5691  inner membrane protein YbcI  47.5 
 
 		 179 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65580  putative membrane-bound metal-dependent hydrolase  48.75 
 
 		 178 aa  143  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04381  inner membrane protein YbcI  42.77 
 
 		 191 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4023  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.67 
 
 		 183 aa  111  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1842  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.89 
 
 		 375 aa  48.1  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251313 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3522  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.52 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34740  membrane-bound metal-dependent hydrolase  38.54 
 
 		 375 aa  45.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01789  hypothetical protein  32.41 
 
 		 314 aa  45.4  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1028  putative metal-dependent hydrolase, membrane-bound  29.41 
 
 		 196 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.508363  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1203  putative metal-dependent hydrolase, membrane-bound  29.41 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000395811  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1308  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.56 
 
 		 354 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.458218 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3169  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.33 
 
 		 359 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0477  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.65 
 
 		 162 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3301  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.17 
 
 		 130 aa  41.6  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2546  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.46 
 
 		 359 aa  41.6  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.355245  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>