29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4023 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4023  membrane-bound metal-dependent hydrolase  100 
 
 
183 aa  363  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5691  inner membrane protein YbcI  43.58 
 
 
179 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0588  membrane-bound metal-dependent hydrolase  43.35 
 
 
193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.455878  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65580  putative membrane-bound metal-dependent hydrolase  44.65 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1266  putative metal-dependent hydrolase, membrane-bound  38.99 
 
 
182 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3150  hypothetical protein  38.99 
 
 
182 aa  107  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.552218  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1380  membrane-bound metal-dependent hydrolase  38.99 
 
 
182 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04381  inner membrane protein YbcI  42.77 
 
 
191 aa  105  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00482  hypothetical protein  38.76 
 
 
173 aa  102  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.275959  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0628  hypothetical protein  38.76 
 
 
173 aa  102  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0247504  normal  0.919705 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00477  conserved inner membrane protein  38.76 
 
 
173 aa  102  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.185455  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0447  hypothetical protein  38.2 
 
 
173 aa  101  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000487062  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0567  hypothetical protein  38.2 
 
 
173 aa  101  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000105687  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0602  hypothetical protein  38.2 
 
 
173 aa  100  8e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000045607  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3086  membrane-bound metal-dependent hydrolase  38.2 
 
 
173 aa  100  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000669215  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3095  membrane-bound metal-dependent hydrolase  38.2 
 
 
173 aa  100  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0342727  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0572  hypothetical protein  37.08 
 
 
173 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0154428  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0593  inner membrane protein YbcI  36.36 
 
 
181 aa  91.3  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417884  normal  0.0138038 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0648  hypothetical protein  36.36 
 
 
181 aa  91.3  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0588  inner membrane protein YbcI  36.36 
 
 
181 aa  91.3  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.337402 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0585  inner membrane protein YbcI  36.36 
 
 
181 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0279815 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0586  inner membrane protein YbcI  36.36 
 
 
181 aa  90.5  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.150683  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2700  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.55 
 
 
361 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3169  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.67 
 
 
359 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2546  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.47 
 
 
359 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.355245  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0477  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28 
 
 
162 aa  44.7  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1308  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.61 
 
 
354 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.458218 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1842  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.21 
 
 
375 aa  41.6  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251313 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0635  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.24 
 
 
163 aa  41.2  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>